冲牙器是一种有效的清理牙齿方式，但换汤不换药，和刷牙比起来没有大区别，而且其弊端是损失大量的唾液。唾液是机体内非常有益的液体，其益处甚至大于血液，所以不要过度使用就好了。
冲牙器对牙刷清洁不到的地方比如牙齿缝、牙龈下、窝沟、鼻腔、龋洞(虫牙)等部位非常有效。但是冲牙器是采用高压高频水冲洗，清洁效果自然很好，但是浪费很多口水。长期使用劣质的冲牙器会导致牙龈萎缩，而出现了牙龈萎缩是不可逆，到时候想抢救都不可以了。
冲牙器不能替代牙刷，不能清洗顽固的污渍，对于有牙结石的患者是很难清洗干净的，但是当前很多商家喜欢夸大宣传，说能有效的清洗牙结石。这是完全夸大了冲牙器的功能。
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