支付宝付的公交车电子发票不能一起开。支付宝合并开票开不了，发票是指一切单位和个人在购销商品、提供或接受服务以及从事其他经营活动中，所开具和收取的业务凭证，是会计核算的原始依据，也是审计机关、税务机关执法检查的重要依据。收据才是收付款凭证，发票只能证明业务发生了，不能证明款项是否收付。简单来说，发票就是发生的成本、费用或收入的
原始凭证。对于公司来讲，发票主要是公司做账的依据，同时也是缴税的费用凭证；而对于员工来讲，发票主要是用来报销的。
支付宝开发票的步骤：
1.在手机里找到“支付宝APP”，点击进入首页。
2.在“首页”页面右上方找到“卡包”按钮，点击按钮进入“卡包”页面。
3.在“卡包”—“卡卷”页面中，找到“公交卡”按钮，点击进入卡片详情页面，注意不要碰到“刷码乘车”按钮。
4.在“卡片详情”页面，找到“申请发票”按钮，点击进入“账单开票”页面。
5.在“账单开票”页面，选择对应要开票信息的按钮，点击“去开票”。
6.在弹出的“选择发票类型”页面，选择点击“开电子发票”按钮。
7.在“申请开票”页面，填写好抬头信息，点击“确认申请”按钮，在弹出的确认发票信息中点击“确认开票”，等待开票成功即可，最后可以点击“查看开票结果”按钮查看发票。