据现在的考证，洪秀全的后裔有两个族群，一个在中国的安徽淮南，一个在日本。这两支洪秀全的后裔都被证实确实为洪秀全的后裔。
洪秀全一生共有十个孩子，据有关资料显示，其中有名有姓的子女有6个，最为著名的就是被清军俘虏的长子洪天贵福，他的结局最为悲惨，在曾国藩的大营里交代了一些他所知道的太平天国秘闻后，被凌迟处死。其他的几个儿子三子天光、四子天明，五子天佑和次女天姣都在天京城破后，受困于天京，根据当时的混乱局面来看，他们存活的几率很小。至于洪秀全其他的不知名的子女，极有可能遇害或者下落不明。
那么安徽淮南的那一支洪秀全后裔是他的哪个儿子的后代呢？
天京城破后，洪秀全已经死了，天王府其实已经很混乱了，洪秀全的几十个老婆也是跑的跑，逃的逃，根本就没人管。其中一个王妃就带着自己的幼子洪来喜逃出来天京城，他们逃到了安徽定远，王妃就改嫁给了一位姓程的人，儿子洪来喜就过继给了程姓人家，改名字为程文起。
王妃携子躲在安徽，逃过了清军的绞杀，过完了平淡的一生，她在临死前将程文起的身世之谜告诉了儿子和后代，要求他们恪守秘密，以免招来杀身之祸。程文起一直活到了1924年，死的时候68岁，他的后代一直生活在安徽淮南。1993年的时候，程文起的后人重修家谱，改姓为洪，而且这一支洪氏后人得到了洪秀全族裔的承认，并且将他们列入了《洪氏族谱》。
那么，来喜到底是洪秀全的哪个儿子呢？根据程文起的年龄来推算，他应该是洪秀全的五子洪天佑，来喜只是他的小名。洪天佑其实还有另外一个身份，他是东王杨秀清的继子，杨秀清在天京事变全族被屠杀后，洪秀全为了安抚军心，重修东王府，重继东王血脉，将自己的儿子洪天佑过继给了死去的杨秀清作为东王继承人。
安徽淮南的洪秀全后裔可以确凿，那么日本的洪秀全后裔又是从何而来呢？这就要从抗日战争说起了，1943年，广东花县官禄㘵村来了一群日本兵，他们簇拥了一位日本军官三叩九拜的来到洪氏宗祠，这位叫洪矢崎义郎的日军军官自称是洪秀全的后人，据讲他的奶奶从小教育他是洪秀全的后代，以后一定要回到中国去祭拜自己的祖先。
这位洪矢崎义郎后来还保护过花县官禄㘵村的洪氏宗祠，如果单凭这么一个故事很难确定洪矢崎义郎是洪秀全的后人，但是从他的后人最后将洪矢崎义郎骗取的洪氏先祖的画像归还洪氏宗祠来看，可以确认他们就是洪秀全的后裔。那么洪矢崎义郎到底是洪秀全的哪个儿子呢？
据国内专家考证，整合太平天国被俘降将和核心人物交代，洪秀全在临死前特意交代将最小的儿子及其部分的亲属秘密送往上海，并通过上海坐船逃亡到了日本。这些信息完全可以从某些资料上找到，那么洪矢崎义郎的说法就得到了印证。
洪秀全的后代都被清军处死了，只有两个侄子逃离海外，才得以生存和生育后代。洪秀全是晚清的农民起义太平天国运动的领袖，他带领的农民起义一度席卷了清朝一半的领土，不仅反列强，也反封建统治，给清政府和列强带来了沉重的打击。然而太平天国运动还是走向了衰败，内部统治阶级互相猜忌，外部清军来势汹汹，最终灭亡。
而洪秀全在天京沦陷之前，就已经去世了。他没能见到天京被攻陷的场景，而他的老婆们、儿子们则是遭遇大难，洪秀全的后人基本都被清军杀光了。
洪秀全煽动农民起义的时候，一直宣传着“人人平等”，那些先进的思想吸引了很多人的注意。大多数底层人民都希望过上这样一种“人人平等”的生活，不希望再被统治者压迫。于是随着太平天国运动愈演愈烈，很多底层人民都加入了起义的队伍。洪秀全也成为了足以与清朝对抗的起义领袖之一。
而洪秀全定都于天京后，他则是开始享受自己胜利的果实。不仅犒劳了自己的下属，还建立自己的宫殿。不仅如此，他还开始仿照皇帝的做法，颁布许多的法令，还为自己纳妃。而且不仅只纳1、2个妃子，而是一次性纳了80多个。据洪秀全的儿子被抓后的口供，洪秀全一共有88个老婆。这与他一开始宣称的“人人平等”完全不同。
从洪秀全失去起义的初衷起，太平天国逐渐走向了衰败，而清军的气势逐渐增高，对太平军的打压也越来越强。不久天京被清军攻陷。洪秀全在天京被攻陷之前已经去世了，而清军来到天京后，对待这些叛贼们一点不手软，天京内部尸横遍野。而洪秀全的老婆们，不是在清军到来之前就自尽身亡，就是被清军俘虏。
说起来洪秀全有88个老婆，那么他的后人应该有很多才对。但是洪秀全仅有4个儿子。洪秀全虽然是纳妃了，但他对这些妃子的控制欲非常强。他根本不在意这些妃子的名字、出身，只用编号来称呼她们，还命她们遵守规矩，不能随便抬头，不能随便发出声音。这些女性在洪秀全的控制下，生活得并不好。
洪秀全的88个老婆，仅为他生下了4个儿子。这4个儿子都被清军处决了。清军不仅处死了洪秀全的儿子，还会洪氏族人进行了屠杀。而清军还不甘心，甚至去洪秀全的老家将所有姓洪的人都处死了。
洪氏后人基本被杀光了，但还是有2人逃过了清军的追剿。他们是洪秀全的侄子，分别是瑛王洪全福和琅王洪魁元。这两人为了躲避清军的追杀，只能逃到海外。洪全福逃去了香港，在香港生育了自己的后人。而洪魁元则是躲到了美国定居，他的一个后人洪威灵还成为了国际知名的医学专家。
总的来说，洪秀全的后人仅有2个侄子洪全福、洪魁元的后代得以存活到现代。
晚清末年最具有传奇性的人物，就是太平天国的领袖洪秀全。洪秀全出生在耕读世家，家境并不富裕，本来是一个科举考试落榜的读书人，在入落榜之后却想建立一个天下为公的太平盛世，为此掀起了太平天国运动。
太平天国运动冲击了清政府的统治，在中国近代史上留下深远而有意义的影响。在太平天国运动在鼎盛时期，洪秀全就为自己设计了豪华庞大的宫殿叫天王府，除了修建皇宫之外，自己还娶了八十八位妃子，每天饮酒纵乐，享受荣华富贵，向皇帝方向发展，完全背离了天下为公的初衷。
要知道，洪秀全还没建立起政权的时候，他就有了十几位女人。洪秀全在南京建立太平天国政权之后，对自己的部下说，自己虽然不是一个皇帝，但需要一个后宫。在后宫里不仅要佳丽三千，也是要三宫六院七十二偏妃。所以，洪秀全为了充实自己的后宫，一共娶了八十一位老婆，后来也取了七个小妾，一共八十八位老婆。
从这里可以看到，洪秀全一生是荒淫无度。根据史料记载，洪秀全本人也是一个脾气暴躁和喜怒无常的人，他的八十八位老婆也是吃了他的苦头。
在曾国藩的湘军攻破天京城之后，在对皇帝的奏折中，也没有提及到洪秀全这八十八位的女人的下场。根据推测，可能洪秀全的八十八位老婆在天京城攻破之后，都没有一个能度过余生的。有些是被清军抓了，死状悲惨，有的是被奸淫致死，有的成为某个清军的老婆。
曾国藩的幕僚赵烈文也曾经说到，天王府里到处都是女人的尸体，有的上吊投河自尽，那么这八十八位妃子应该在这下场里面。如谭嗣同根据当地的流传说，“子女玉帛，扫数皆入湘军”，也就是很多天王府的女人都被抓到了，成为湘军的战利品，大概也就是说明了洪秀全八十八位妃子的结局。曾国藩没有把这些写到奏折里，恐怕也是出于为湘军掩埋罪过！
洪秀全虽然有八十八个妃子，却一生只给他生了4个儿子，在太平天国灭亡后，他的四个儿子，都被清兵所杀。后来，清朝皇帝痛恨洪秀全，就对洪秀全的后人进行了追杀，只要与洪秀全沾亲带故的，被封为王爷的洪氏族人，大部分都是被清朝廷抄家灭族。
之后同治三年，清军攻破天京把太平军打败之后，洪氏族人纷纷逃亡。当清朝朝廷怀疑洪氏族人逃到老家官禄布村，于是又派人去围剿，在这一次村里剩下洪氏家族都杀尽。这样，经过清朝朝廷的两次屠戮之后，村里也没有这这洪氏家族的存在。
如果说当时数量众多的洪氏家族成员能够生存，可能是逃亡海外。因为在国内清朝官府对洪氏家族成员都是赶尽杀绝，只要逃到海外才能保全性命。
目前能够查到的洪秀全后人仅有两个旁系存世，一支是瑛王洪全福的后人，洪全福是洪秀全的侄子，当年洪全福在清廷的逼迫下先是逃到香港，以给别人当厨师来维持生计，后来又加入了洪门成为洪门帮派的魁首，最后病逝于香港。
另一支是琅王洪魁元的后人，洪奎元也是洪秀全的侄子。当年洪魁元远赴美国避难，至此以后就在美国定居。他的后人洪威灵现在是国际上著名的医学专家，算是洪氏后人中比较出名的一个。所以，当年洪秀全封了那么多侄子当王爷，最后只有这两个人幸存下来。