研究区金属矿产分布范围较广，大部分矿床（点）的研究程度较低，对矿床类型的认识也不统一。根据对现有资料的初步分析，东准噶尔地区优势金属矿产主要有以下7种类型。
1.5.1.1 斑岩型铜（金）矿
斑岩型铜（金）矿主要分布于研究区北部及东部地区，典型矿床（点）包括蒙西铜钼矿床、哈腊苏铜矿床、玉勒肯哈腊苏铜矿床、卡拉先格尔铜矿床、喀腊萨依金铜矿点、老山口铜矿点、和尔赛铜矿点和铜花岭铜矿点等。铜矿化主要产于古生代岛弧带中，中酸性浅成岩体是重要的控矿地质体，赋矿岩石类型有闪长玢岩、斜长花岗斑岩、花岗斑岩、花岗闪长斑岩、英安斑岩、二长斑岩及长英质爆破角砾岩等，成矿斑岩体为多期次、高侵位的小岩体。矿石建造以Cu-Mo组合为主，也有Cu-S型和Cu-Au型等。围岩蚀变强烈，具分带性，从高温到低温，早期的钾硅酸盐交代形成钾长石化和黑云母化带，以及钾质角岩及少量镁钙矽卡岩；中期生成绢云母带-黄铁绢英岩带及青磐岩带；晚期低温蚀变包括泥化带、浊沸石-硫酸盐化带。其成矿往往与多种成因类型铜矿化伴生，常见有相对深部的矽卡岩型铜矿化、浅部脉状铜矿化、斑岩体附近围岩中的火山-沉积型层状铜矿化等，形成多位一体的矿床成矿系列。
1.5.1.2 岩浆型铜镍矿
岩浆型铜镍矿以喀拉通克铜镍矿为代表，产于显生宙新陆壳固结后的弛张性深断裂带内。杂岩体为一些小而高分异的凸镜状、漏斗状侵入体，与围岩呈热侵入接触，界线清楚。围岩有角岩化、绿泥石化、透闪石化，内接触带有同化混染。主矿体产于苏长岩和橄榄苏长岩带内。矿化主要以就地熔离为主，形成稠密浸染状-稀疏浸染状-海绵陨铁状矿化，有时以矿浆贯入形式产出。主要成矿元素为Cu、Co、Ni、Au、Ag、Pt、Pd、Se等。
1.5.1.3 矽卡岩型铜、铁矿
矽卡岩型铜、铁矿以索尔库都克铜钼矿、宝山铁矿为代表。构造环境主要是汇聚板块边缘造山带的古生代岛弧带。矿化产于中酸性侵入岩与围岩接触带上，与矽卡岩铜矿有关的侵入岩主要为钙碱性系列岩石，岩石系列组合为花岗岩-斜长花岗岩-花岗闪长岩-闪长岩，岩石成因多为同熔型。矿体多为透镜状和不规则状。矿石金属矿物主要有黄铜矿、黄铁矿、斑铜矿、辉铜矿、磁铁矿、方铅矿、辉钼矿、闪锌矿和毒砂等，脉石矿物有石榴子石、透辉石、绿帘石、石英、阳起石、角闪石、绿泥石和方解石等。近矿围岩蚀变主要为矽卡岩化。其成矿时代主要为海西中、晚期。索尔库都克铜钼矿矿区地层为中泥盆统北塔山组中—基性火山岩，与成矿有关的岩体则为海西中期辉石闪长岩。
1.5.1.4 浅变质碎屑岩型金矿（穆龙套型）
浅变质碎屑岩型金矿以萨尔布拉克金矿为代表，含矿岩系产于陆缘海或深海的缺氧环境，金矿床常定位于渗透性片理化带中，受层位与构造双重控制。含矿岩系为富含炭质和硫化物的含炭质粉砂岩、岩屑凝灰岩及条带状沉凝灰岩等，遭受浅变质或动力变质作用，为石英岩-板岩或千枚岩或片岩组合。矿体呈似层状或板状，兼有透镜状及脉状者，矿石结构呈他形—自形晶粒或碎裂、糜棱结构，矿石构造多为细脉、网脉浸染状、团块状及角砾状。矿石物质成分一般较简单，载金矿物主要是黄铁矿和毒砂。含金矿物主要是自然金与银金矿。围岩蚀变不强，一般可划分出硅化、绢云母化和碳酸盐化等带。
1.5.1.5 石英脉-云英岩型锡矿
石英脉-云英岩型锡矿主要分布于谢米斯台-库兰卡孜干古生代复合岛弧带中，代表性矿床有卡姆斯特锡矿、贝勒库都克锡矿、萨若什克锡矿等。矿化与海西中晚期中—酸性侵入岩有关，产于岩体内及接触带附近，岩体主要为高碱的钾质花岗岩、正长花岗岩、二长花岗岩和碱长花岗岩等，SiO2含量高，在73%以上，碱质含量高，多为S型或A型花岗岩。有石英脉型和云英岩型两类。前者含锡石英脉一般成群分布于花岗岩体节理或裂隙中，长数十米至百余米，宽1～4m，锡石颗粒大，晶型好，呈浸染状或细脉状分布；后者云英岩发育于岩体的顶部或边缘内外接触带，在其下部往往有较强的钾化和钠化等自变质作用，云英岩在岩体内接触带多沿其边部呈不规则的面状或团块状出现，形态复杂，在外接触带则多呈脉状成群出现，与云英岩化伴生的有电气石化、黄玉化、萤石化和白云母化等。矿石矿物主要为锡石，其次有黑钨矿、辉钼矿、黄铜矿及方铅矿等，脉石矿物有石英和长石等。
1.5.1.6 晚期岩浆高铬低铝型铬铁矿
晚期岩浆高铬低铝型铬铁矿主要分布于阿尔曼太蛇绿岩带、卡拉麦里蛇绿岩带，代表性矿床（点）有平顶山、扎河坝、兔子泉及臭水泉等。
含矿岩体岩石建造属含铬橄榄岩建造中的纯橄榄岩-斜辉辉橄岩亚建造。一般岩体岩浆分异性差，岩相分带性不明显。矿体多呈似脉状、凸镜状或条带状产出，其直接围岩为纯橄榄岩，二者间的接触关系多呈渐变接触关系，也有呈截然清楚的突变接触关系。矿体个体小而数量多，常呈矿体群出现，一个矿床中往往有几十个至数百个矿体。单个矿体一般长几米，厚几十厘米，有时长达50m左右，厚约5m，最大矿体规模亦不超过1×104t。矿石类型主要为中度或稠密浸染状构造类型，其次还有致密块状、团块状、斑杂状、条带状及少量网环状、豆状等类型。矿石矿物成分，除铬尖晶石外，金属矿物还有少量的磁铁矿、黄铁矿、镍黄铁矿、针镍矿和褐铁矿。脉石矿物主要以纤维蛇纹石和淡斜绿泥石为主，其次为橄榄石、铬绿泥石、菱镁矿、滑石、水镁石和钙铬榴石等。矿石中铬尖晶石以镁质富铁铬铁矿、镁质铬铁矿和富铁铬铁矿等富铬低铝的铬尖晶石为主，个别矿床中也见有铝铬铁矿类型的铬尖晶石。矿石主要化学组分明显地反映出铬高、铝低，铬铁比值大的特点。矿石多呈半自形—自形晶的中—粗粒结构，或半自形—他形晶的粗—伟晶结构。
1.5.1.7 火山岩型金矿
火山岩型金矿主要指火山岩作为赋矿岩系的金矿，包括海相和陆相火山岩型金矿两类，前者以清水48号金矿为代表，分布于卡拉麦里、库兰卡孜干等古生代沟弧带中；后者以金山沟金矿为代表，主要分布于东准噶尔晚古生代陆缘盆地内。
海相火山岩型金矿主要控矿地层为中泥盆统中基性火山岩-火山碎屑岩建造及下石炭统陆缘碎屑岩-火山碎屑岩建造。金矿体主要产于含金石英脉及破碎蚀变带中，石英脉以单脉为主，部分地段为细脉和树枝状复脉。矿石结构主要有粒状结构、压碎结构、鳞片变晶结构等，构造主要是碎裂构造、浸染状构造和条带状构造等。矿石类型有含金石英脉型和破碎蚀变型两类。矿石矿物主要为黄铁矿、黄铜矿、磁铁矿、白铁矿、辰砂、毒砂、方铅矿、白钨矿及自然金等。矿化受大断裂旁侧次断裂控制，含金破碎带常位于中基性火山岩与碎屑岩的交界处。
陆相火山岩型金矿主要控矿地层为上石炭统陆相中酸性火山熔岩-火山碎屑岩建造。金矿化受火山机构控制，产出形式有火山颈相、火山喷溢相及放射状、环状裂隙。热液蚀变较强，主要为次生石英岩化和黄铁绢英岩化。矿石矿物主要为黄铁矿、闪锌矿、方铅矿、黄铜矿及自然金等。矿化类型主要为含金石英脉，含金品位偏低，并见有多金属矿化，含银较高。属浅成低温热液型金矿。