兽药生产质量管理规范的第六章专门强调了卫生管理的重要性。首先，第五十二条明确要求企业应实施严格的卫生措施，包括制定环境、工艺、厂房和人员卫生管理制度，并指定专人负责执行，确保生产过程中的无污染环境。
第五十三条针对各个生产环节，特别是生产车间、设备和管道，规定了详细的清洁操作规程，包括清洁方法、程序、间隔时间和使用的清洁剂或消毒剂，以及清洁工具的清洁和存放要求，以保持空气洁净度的高水平。
第五十四条强调了生产区域的整洁，禁止吸烟和存放非生产物品，废弃物需及时处理，以维护生产环境的清洁。第五十五条规定，更衣室、浴室及厕所的设置需符合洁净要求，避免对洁净室产生不良影响。
工作服的选择和管理在第五十六条中尤为重要，工作服应适应空气洁净度级别，有明显的标识，且不能混用。无菌工作服需全面覆盖头发、胡须和脚部，以减少人体脱落物对洁净环境的影响。工作服清洗、消毒有专门的制度，确保不会引入额外的颗粒物质。
第五十七条和第五十八条针对人员管理，规定了洁净室的人员准入和行为规范，如不得化妆、佩带饰物，以及直接接触兽药的规定。第五十九条提到，卫生工具的选择和使用也需谨慎，应选择无脱落物、易清洁和消毒的工具，并在指定地点存放，以防止污染。
第六十条则要求生产人员建立健康档案，定期体检，确保直接接触兽药者的健康状况。传染病、皮肤病患者以及有伤口者不得参与直接生产，以确保兽药的质量安全。
《兽药生产质量管理规范》，根据《兽药管理条例》规定而制定，适用于兽药制剂生产的全过程、原料药生产中影响成品质量的关键工序。该规范共十四章、九十五条（含附则），自2002年6月19日起施行。