脂肪酸合成酶复合体一般只合成软脂酸，碳链延长一般由
线粒体或内质网酶系统催化。
软脂酸的合成实际上是一个重复循环的过程，由1分子乙酰CoA与7分子丙二酰CoA依靠合成酶复合体，经转移、缩合、加氢、脱水和再加氢重复过程，每一次使碳链延长两个碳，共7次重复，最终生成含十六碳的软脂酸.
脂肪酸碳链延长反应 - 线粒体中的延长乙酰CoA提供碳源，NADPH提供还原当量，反应过程类似β-氧化的逆过程，每一轮可延长两个
碳原子，一般可延长脂肪酸碳链至24或26碳，但以十八碳的
硬脂酸为主。脂肪酸碳链延长反应 - 内质网中的延长 丙二酸单酰CoA提供碳源，NADPH供氢，反应过程与软脂酸的合成相似，不同的是CoASH代替ACP作为
酰基载体，每循环一次可增加两个碳原子，一般可延长至22或24碳，但也以硬脂酸为主 。