食品安全隐患有：
1、过度使用各种添加剂。食品中存在着超范围、超剂量使用有添加剂的情况，虽然这些添加剂对人体是无害的，但是过多的添加添加剂同样会增加身体的负担，因为一些添加剂需要肝脏进行分解和代谢，增加了肝脏的负担；
2、微生物的污染。现在很多人喜欢生吃食物，比如海鲜或者是半生不熟的牛排等，甚至涮火锅也是半生不熟就吃，这样导致了食物中的微生物进入人体，危害人的健康；
3、有一些食物的质量不达标。这样的比例占总食品的17%左右，虽然比例不是很高，但是这依然是隐患；
4、重金属污染。这种污染很可能来源于水质，工业化现代化的进程，导致了水源的重金属污染严重，而用这些水制作出来的食品自然就含有重金属，此外，还存在制作过程中的少量重金属的污染；
5、农药残留超标。农药超标是可以直接导致人中毒的，现在依然有一些食品发生农药超标的情况，这种情况如果不遏制，也将是后患无穷；
6、生物毒素的污染。这种污染来自各种生物本身，虽然占有的比例也非常低，但是也不能忽视，这种生物毒素也会引起一些健康的问题。
食品安全隐患的危害如下：
1、危害公众身心健康和生命财产安全。人类的生存与发展离不开安全的食品，不安全食品常常会致使食用人组织器官产生急性、亚急性或慢性损害，学术上称之为食源性疾病。有的会产生一过性身体不适，有的还可导致基因突变，严重时危及生命。由于该类产品是公众的生活必需品，不论是在使用空间上，还是在使用人群上都具有广泛性特点，一旦发生安全事故就是群体性事件；
2、破坏社会稳定和谐。因为食品安全事故一般均为群体性事件，牵动社会的方方面面，常常导致社会不稳定。如奶粉事件，波及面之宽，受害人群之广，让整个社会产生安全危机，同时导致三鹿集团数万名职工失业。当前，众多的家庭对中国的奶粉产生不信赖，有的家长放弃对孩子喂养奶粉，有的甚至到国外采购奶粉；
3、影响经济发展。随着国家经济的高速发展，食品产业成为拉动经济的重要力量，中国五百强企业中不乏食品企业，如近年来，出现重大安全事故2008年的三聚氰胺奶粉事件曝光后，夜之间轰然倒塌，人们无不为多年来精心打造的国家品牌民族企业而感到惋惜。广大消费者对国产乳品失去信心，巨大的乳品消费市场被国外品牌所占领，也影响到我国食品出口。
综上所述，食品安全隐患有生物性危害：细菌、霉菌、病毒、寄生虫。化学性危害：重金属、自然毒素、农用化学药物、洗消剂。物理性危害：碎骨头、碎石头、铁屑、木屑、头发、蟑螂等昆虫的残体、碎玻璃以及其他可见的异物。
【法律依据】：
《中华人民共和国食品安全法》第一百零九条
县级以上人民政府食品安全监督管理部门根据食品安全风险监测、风险评估结果和食品安全状况等，确定监督管理的重点、方式和频次，实施风险分级管理。
县级以上地方人民政府组织本级食品安全监督管理、农业行政等部门制定本行政区域的食品安全年度监督管理计划，向社会公布并组织实施。
食品安全年度监督管理计划应当将下列事项作为监督管理的重点：
（一）专供婴幼儿和其他特定人群的主辅食品；
（二）保健食品生产过程中的添加行为和按照注册或者备案的技术要求组织生产的情况，保健食品标签、说明书以及宣传材料中有关功能宣传的情况；
（三）发生食品安全事故风险较高的食品生产经营者；
（四）食品安全风险监测结果表明可能存在食品安全隐患的事项。
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