过磷酸钙适用于各种土壤和作物，可作基肥和追肥，也可以叶面喷施。施用磷肥应采用集中施用的方法，这样可以减少磷肥与土壤的接触面，降低磷的化学固定，促进磷向作物根系扩散，有利于作物对磷的吸收利用，提高磷的有效性，如采取穴施、条施或沟施的方法。施用量视土壤缺磷状况而定。过磷酸钙作基肥可与有机肥料混合施用，也有利于减少磷的固定。
作根外追肥时，将过磷酸钙配制成水溶液，在作物生长中后期喷洒于叶面上，供作物直接吸收。配制方法是将过磷酸钙浸泡于10倍的水中，充分搅拌并放置过夜，取其上层清液，经稀释后配成0.5%～1%的浓度进行喷施。