建造师原单位不配合调出，建造师可以办理个人变更或者注销。
办理流程如下：
1、注册系统个人申请变更点击上报，选择“逾期未调出”、办理系统注销时不需要操作（办理此项业务不能存在其他在办业务）。
2、提供解除劳动关系证明至省厅，由建设厅代替原单位点击调出（证明材料三选一：解聘证明、劳动仲裁、法院判决书），办理此步骤时，建造师本人可以选择现场提交或者选择邮寄证明材料的方式。
3、提供变更或注销的申报材料，按照正常流程所需要的资料，其中申请表原单位未盖章或者证章被扣留等情况用“解除劳动关系证明”和“情况说明”来代替。
二、办理二级变更注册（原单位扣证）的可以使用情况说明（建设主管部门盖章）和遗失声明代替注册证书原件，劳动仲裁或者法院判决代替解聘证明，办理变更。