司马光在《资治通鉴》中是以曹魏为正统的，这个也与当时的政治环境有关的，三国时期都以汉为正统，刘备蜀汉是大汉的延续，视曹魏为乱臣贼子；而宋朝原本也非正统，是赵匡胤通过陈桥兵变夺取后周天下的，曹魏与北宋开国本质在政治立场上有异曲同工之妙。
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后周显德七年（960）正月初一，镇、定二州剌史派员进开封向朝廷送来紧急战报，称契丹与北汉联合大军掠境，请求朝廷出兵御敌。宰相范质、王溥未核实军情，仓促派遣赵匡胤率领宿卫禁军前往抵御。 都点检赵匡胤在出兵北伐的途中，策划黄袍加身，逼柴宗训退位，建立了宋朝，史称北宋。宋朝的建立与曹魏有着相似之处，那就都是权臣凌迫皇帝从而建立起的政权。
参考资料来源：百度百科-北宋
正统应当是魏国。因为在《资治通鉴》中的所谓的“正统”观念其实是司马光的个人见解。以三国时期为例：要说符合礼乐制度、纲常伦理、儒家思想，那应当以蜀汉为正统而非曹魏。
但事实上《资治通鉴》中只有“魏纪”而没有“蜀纪”或者“吴纪”，司马光在描写诸葛亮率军围祁山的时候这样写道：“亮帅诸军入寇，围祁山，以木牛运。”就是称诸葛亮为寇为贼，这让后世很多的儒家学者不满，朱熹就曾经表达过自己的不满，并且试图修撰《资治通鉴》，后来因为种种原因作罢。
而在《资治通鉴》中，魏有“纪”，蜀、吴无“纪”，是因为晋顺魏而生，当以魏为正统。南朝有“纪”，北朝无“纪”是因为南朝多汉人北朝多胡人，司马光当以汉人为正统，五代有“纪”，而十国无“纪”，五代十国中后梁、后唐、后晋、后汉、后周的行政区划位于中原，并且宋继后周而生，当以五代为正统。因此，司马光对“正统”应该是这样考虑的。
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《资治通鉴》（常简作《通鉴》），由北宋司马光主编的一部多卷本编年体史书，共294卷，历时19年完成。主要以时间为纲，事件为目，从周威烈王二十三年（公元前403年）写起，到五代后周世宗显德六年（公元959年）征淮南停笔，涵盖16朝1362年的历史。
在这部书里，编者总结出许多经验教训，供统治者借鉴，宋神宗认为此书“鉴于往事，有资于治道”，即以历史的得失作为鉴诫来加强统治，所以定名为《资治通鉴》。《资治通鉴》全书294卷，约300多万字，另有《考异》、《目录》各三十卷。《资治通鉴》是中国第一部编年体通史，在中国官修史书中占有极重要的地位。
参考资料：百度百科-司马光与资治通鉴
本回答被网友采纳可以看出，司马光对中国正统王朝的定义是这样的：
1、汉族王朝统一中国时，正统毋庸置疑；
2、多个汉族王朝并存时，较大的一个为正统；本回答被提问者和网友采纳