001 云霄飞车杀人事件（初登场）
工藤新一002 董事长千金绑架事件（兰的回忆&.远影）
007 每月一件礼物威胁事件（远影）
010 足球选手恐吓事件（照片、想像&.投影）
018 六月新娘杀人事件（回忆）
026 爱犬约翰杀人事件（回忆）
032 咖啡店杀人事件（回忆）
033 侦探团生还事件（远影）
042 卡拉OK厅杀人事件（远影）
048 外交官杀人事件(前篇) （回忆）
049 外交官杀人事件(后篇)（重感冒后喝下平次带来的白干酒变大）
057 福尔摩斯迷杀人事件(前篇)（回忆）
076 柯南对怪盗基德 (远影)
084 滑雪别墅杀人事件(前篇)（回忆）
096 走投无路的名侦探 连续两大杀人事件 （照片＆.想像）
100 初恋情人回忆事件(前篇)（回忆）
101 初恋情人回忆事件(后篇)（回忆）
118 浪花连续杀人事件（平次的梦－－工藤被袭击）
129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件 （远影）
162 飞天密室！工藤新一最初事件（兰睡梦中回忆的）
190 危命的复活～第三种选择（平次扮的，后被远山和叶识破，揭穿） 191 危命的复活～黑衣骑士 （变回来的）
192 危命的复活～新一回来了（药效没过）
193 危命的复活～约定的场所（药效没过，但结尾就过了）
196 看不见的凶器 小兰的初次推理 （兰的想象）
217 被封印的目暮秘密（远影）
219 名侦探大集合 工藤新一vs怪盗基德 （回忆）
228-暗藏杀机的陶艺教室 (前篇)（兰的想象）
239 大阪的3个K事件(后篇) （远影）
250 偶像们的秘密(后篇) （星野辉美手中的剪报）
253 本厅刑事恋爱物语4(前篇)（远影）
255 松江玉造连句十四次胜负(前篇) （出现原因不明新一看见小狗走神） 271 急忙掩饰的忽略 (前篇)（小兰上课走神，想起了赤井秀一和新一） 278 英语教师VS西部名侦探(后篇) （照片）
280 迷宫的阴暗（后篇）（柯南回忆足球明星比护来学校找他加入球队） 284 中华街雨中的似曾相识(前篇) （兰的错觉）
285 中华街雨中的似曾相识(后篇) （兰的错觉)
286 工藤新一NY事件(事件篇) （回忆）
287 工藤新一NY事件(推理篇) （回忆）
288 工藤新一NY事件(解决篇) （回忆）
300 友情与杀意的关门海峡(后篇) （回忆）
304 震动的警视厅 1200万人质 （兰的错觉＆.远影）
312 染上夕阳的布偶(前篇)（回忆）
330 被挑拨的友情(后篇)（回忆）
331 疑惑的咖喱饭(上篇)（想像）
343 便利店中的阴谋(前篇)（回忆&.远影）
344 便利店中的阴谋(后篇) （错觉、照片&.远影）
345 直面黑色组织的对决！满月之夜的二元神秘事件（平次假扮&.回忆） 382 谁的推理秀(后篇） （服部回忆外交官杀人事件工藤说的话）
383 来自甲子园的恶魔的挑战（兰的回忆）
387 斯特拉蒂瓦里的不谐和音（尾曲）（柯南回忆自己唱歌）
398 奇妙一家的委托(前篇) （想象）
399 奇妙一家的委托(后篇) （兰的想象）
400 心存疑惑的兰(回忆&.远影）
410 同时进行的舞台剧和绑架案(后篇) （回忆）
411 神社鸟居之惊悚暗号
412 神社鸟居之惊悚暗号（远影）
422 银杏色的初恋(后篇) （回忆）
413 完全一半犯罪之谜 （柯南的回忆）
423 侦探团与青虫四兄弟（远影）
434 名犬cool的功劳（远影）
437上户彩和新一 四年前的约定（回忆）
456 我喜爱的推理 （回忆看齐川的小说）
457 园子的红手帕(前篇) （园子给兰打比方……）
472 少年工藤新一的冒险(前篇)
473 少年工藤新一的冒险 (后篇)
490 工藤新一vs服部平次 滑雪场的推理对决（中学时候，推理部分最好看） 508卡拉OK厅的死角(后篇)（回答瑛佑的问题：想要和兰表白……的时候远影） 511 推理对决！新一vs冲矢昴（最后和兰打电话时的远影）
517 风林火山 阴和雷霆的对决（远影）
521 杀人犯、工藤新一（以其身份登场的是个整容的犯人，真人开始是柯南，之后化妆成死罗神）
522 新一的真实身份和兰的眼泪
523 真正想问的事
524 憎恶的蓝色火花(前篇) （开头一些提到了）
545 雾中尖叫的魔女(前篇)（远影）
557 与危险的二人同行(柯南和哀打电话时出现了一下）
565 没有看见的目击者（开头提到 想象）
573 于心有愧的护身符的去向(前篇) （小兰回忆522集的情形．．．．）
076 柯南vs怪盗基德
132 魔术爱好者杀人事件(事件篇）
133 魔术爱好者杀人事件(疑惑篇）
134 魔术爱好者杀人事件(解决篇） 注：有人曾经说是“突金塔克树”，但按照假名来看，显然应翻译为土井塔克树。
219 被召集的名侦探！工藤新一vs怪盗基德
356 怪盗基德的惊异空中步行
395 奇异屋宇的大冒险（机关篇）
396 奇异屋宇的大冒险（解决篇）
469 怪盗基德与四幅名画（前篇）
470 怪盗基德与四幅名画（后篇）
472 工藤新一少年时的冒险（前篇）
473 工藤新一少年时的冒险（后篇）
515 怪盗基德瞬间移动（自身）
537 怪盗基德VS最强金库（前篇）
538 怪盗基德VS最强金库（后篇）
M14公开纪念特别篇 怪盗基德诞生的秘密
571 妖怪仓库中的夺宝战斗(前篇)（柯南回忆）
参考资料：百科