首先要了解结石的具体位置、大小、数量及肾脏的功能，再制定最合适的治疗方案。若结石不在肾盂及肾盏内则可不行处理，反之则行处理。
1、0.5公分以下的肾结石，这样的结石不是很大，可以选择排石治疗。喝德甫的蓹石蓪茶，长期喝不仅可以调理内部，还对排石有帮助。
2.对体积略大（直径8毫米左右）的结石，如果肾功能良好而又没有泌尿系统梗阻的话，可以采用碎石机进行体外冲击波碎石。
3、对结石体积大（直径10毫米以上），同时出现血尿、感染、肿瘤或泌尿系统梗阻等合并症，以致影响了肾功能，则应进行手术治疗，及时取出结石。
肾结石患者除了积极地进行治疗和科学的饮食的同时，还以可以配合着做一些运动疗法，以使肾结石的治疗更快，恢复更好。肾结石的运动疗法：
1）结石位于肾脏上部时，患者可在原地双脚跳跃5分钟以上，输尿管中段结石患侧单脚跳跃，输尿管下段结石健侧单脚跳跃。
2）结石位于肾脏中部时：患者宜侧卧，取患侧向上卧位。
3）结石位于肾脏下部时：患者不能应用以上方法，病友应当经常采用倒立或臀膝位(俯卧于床，臀部抬高，头低位)。
没事的时候可以做一做，帮助结石的排出。对于肾结石的运动疗法，必须根据B超所示结石的部位，来选择相应的运动疗法，否则不但不利于结石排出，反而会使病情加剧。有时B超医师并未明确指出结石在肾中的位置，故询问B超医师是必要的。注意：肾绞痛剧烈时应暂停运动疗法，并及时至当地医院治疗。
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