你的问题在PS中基本无解，我倒有个想法，但刚才试了半天也没实现：
把每种个颜色的点单选出来，然后用选区创建切片，然后存出切片，每个切片就是一个小图片，你去数下存出去的小图有多少个就可以了。但问题有一个，怎么按选区来自动切片，就是这个问题没有解决。
或是按图层切片也可以，单提出来一种色的点建一个图层，然后让他能自动按些图层的有效象素来切片，存出，数图。但也没能实现。
所以现在觉得如果能实现以上说法，能解。如不能。就不要靠PS了
-------终于找到解决办法了，我也算没白研究-------------------方法如下：更新中-----------
先用任意选区工具，魔棒、巨型、套索等都可以，右键-色彩范围-选择一种颜色，
我以黑色为例，容差值32就好，确定
下面就可以一步算出有多少个黑点了，窗口-测量记录-点记录测量
看下吧，这个就是有多少个选区了，也就是多少个点了，
出现在记录第一行是个总数，下面的每一行显示的就是每一个选区（圆点）的数据。
所以他显示的是157个计数，那算上本条，下面应该就是158条记录，呵呵，明白了吧，
其实就看第一条那写的是多少，就是多少个选区（圆点）了。
真是功夫不复有心人，我也算多了项知识！
我所掌握的PS计算像素的方法，楼主的图可能不适用。但在这里说一下，看是否能帮到楼主。
首先图片的颜色需按最小像素排列，比如上图中的某一红色，它只有一个最小单元像素。
所以，上图中将每个小圆点都处理成最小单元像素，难度还是比较大的。但如果需要精确数据，这个处理过程却是必须的。
如果上图小圆点都处理成最小单元像素，那么就可以按楼上所说，每个颜色请点出选区，然后CTRL+J得到新图层。选中该图层，并取消其它图层的显示，打开直方图，源：选中的图层，那么，在像素中，将自动统计数据。
注意，CTRL+J是提取某一颜色，它利用直方图不统计透明像素的功能，也就是说，只要把其它像素变成透明像素即可。当然，如果不需要精确也可以估算一个值，比如，上面的圆点，每个圆点大概包含50个像素，直方图统计出来是100000值，那么圆点的个数就是100000/50＝2000
笨办法，见笑了`~
本回答被网友采纳选取相似后给个蒙版再数，
这张图太大，有上万个点组成，查着太慢，有没有自动统计的方法。
追答貌似没有！
貌似没有！