克拉斯诺亚尔斯克边疆区是俄罗斯自然资源最丰富的地区之一。边疆区内最丰富的资源是石油、天然气、水力、针叶林、金属混合矿、铁矿、石炭、金子和稀有金属、非金属。
动、植物资源：克拉斯诺亚尔斯克边疆区的植物丰富多样，具有明显的经线、纬线分带现象。从100米至3000米的高度，景色各异、具有多层次的自然景色。森林覆盖率为45%，森林分北部森林（沼泽林）、中部森林（密密的针叶林，即红松、落叶松、冷杉）、南部阔叶林带三部分。边疆区南部为草原和森林草原。
克拉斯诺亚尔斯克边疆区是木材储量最丰富的地区之一。木材总储量为76亿立方米，占全俄罗斯的9.3%。其中包括成材和过熟材52亿立方米，占边疆区木材总储量的68.9%。
在边疆区内生长有450多种植物，包括具有工业价值的品种，约有60多种植物受国家保护。
在动物世界中有342种鸟类和89种哺乳动物，其中有60万只北鹿种群。在北冰洋的岸边及水里有白熊、海象、海豹、环斑海豹。在冻土带上有狐狸、狼、北极狐、白鼬及多种鸟类。在密林中还有棕熊、驼鹿、马鹿、鹿、狍、紫貂、猞猁、松鼠。江河及湖泊里鱼类繁多，有鲟鱼、小体鲟鱼、哲罗鱼、茴鱼、狗鱼、白鲑及其它的约30多种鱼类。
水力资源：克拉斯诺亚尔斯克边疆区的水力资源在俄罗斯各州中算是丰富的，河流流量每年达700立方公里，占俄罗斯的20%。
克拉斯诺亚尔斯克边疆区的河流属喀拉海流域，有世界最大的河流之一——叶尼塞河（它发源于萨彦岭，位于亚洲东部），总长4092公里。
叶尼塞河的下游宽12公里，在喀拉海入口处为40——50公里。叶尼塞河支流众多，如有流入拉普捷夫海的皮亚西纳河、赫塔河和在边疆区内形成天然交通网的丘雷姆河、阿加拉河。
河流的流速从3—5米/秒至10—12米/秒，河中急流瀑布很多。克拉斯诺亚尔斯克边疆区内湖泊众多，总计为32.3万个，占俄罗斯湖泊总数的11%多。众多湖泊中大的湖泊不多，86%的湖泊位于北部，南部的湖泊多为矿泉湖和泥疗湖。克拉斯诺亚尔斯克边疆区北部有北冰洋的两个海域，即喀拉海和拉普捷夫海。海面每年有长达9个月的时间覆盖着冰层。尽管有破冰船，但北部航线几乎整年使用驳船。矿产资源储量占俄罗斯之最：克拉斯诺亚尔斯克边疆区集中了俄罗斯的铂金、准铂金、铜、镍的主要储量，其主要的矿产地位于北方，包括泰梅尔半岛、伊斯兰特草原。其金矿开采在俄罗斯各州中占主导地位。
戈列夫斯克矿产地的铅的储量较大。在开采铅的同时可以得到其它的矿产，如银、锗、碲、镓、铟。磷灰石和霞石是生产铝的主要原料，边疆区北部的磷灰石矿的含量占整个俄罗斯储量的21%。
安加拉斯克的菱镁矿基地的储量达5亿吨，且质量高，是俄罗斯最大的菱镁矿。高纯度的菱镁矿可用来提炼金属镁。
在北部的诺里尔铜矿基地开采了10多个金属伴生矿，其开采方式是露天和非露天，由诺里尔矿山冶金联合企业负责加工矿产，它保证了俄罗斯大部分的铜、镍、钴和铂金的开采。
在安加拉河和石泉通古斯卡河之间的铝土矿储量据估计有1亿吨。“中心”铝土矿基地高含稀有金属和稀土，总计储量为5000万吨。
克拉斯诺亚尔斯克边疆区煤炭的总储量为863亿吨，其中工业用煤占7%。“克拉斯诺亚尔斯克煤炭”中心区每年开采约6000万吨煤炭。
卡翁斯克——阿钦斯克的褐煤区的储量也是惊人的，且适合于露天开采。其总储量为639亿吨，占俄罗斯动力煤储量的66%，其中622亿吨可露天开采。
在克拉斯诺亚尔斯克边疆区共开采了25个石油、天然气基地。据估计，工业类石油储量为6亿多吨，天然气和天然气冷凝油超过10000亿立方米和5000万吨。
