当地时间2020年1月26日（北京时间2020年1月27日），科比在加州卡拉巴萨斯因直升机事故遇难，享年41岁。
北京时间2020年1月27日凌晨，科比和二女儿以及一些家属乘坐科比的私人飞机前往洛杉矶参加青年锦标赛，在半路上飞机出现事故坠机，机上9人全部遇难。
根据当地航空数据显示，科比乘坐的飞机遇到大雾，不得不在875英尺的上空盘旋。由于大雾没有散去，飞机一共盘旋了6次，之后才发生的坠机事故。验尸报告显示，飞机驾驶员体内并没有酒精和任何非法物品，所以这次的事故完全是由于天气原因导致的。
为了躲避浓雾，飞机一度从1200英尺上升到2000英尺，五分钟之后飞机进入高山地带，随后发生坠机事故。根据当时的目击者说明，飞机坠入山林后短时间内就产生了小型爆炸，机上所有人员不幸身亡。
科比去世之后，他的妻子为科比父女举行了一个小范围的私人葬礼。之后，科比的追悼会正式在斯台普斯球馆举行，现场有2万名球员及球队代表参加，主持人是科比的好朋友吉米坎摩尔，天后碧昂丝也登台献唱。
科比已经去世两周年了，当地时间2022年1月26日，洛杉矶湖人官方平台发布了科比与吉安娜在球队主场观看比赛的黑白照片，并在配文写道：“一辈子的家人！”同时，NBA官方及各家球队纷纷在评论区用紫色和金色的爱心向科比表达哀思。
这一天是卡特的45岁生日，他在社交平台发文：“很感激又迎来了新的一岁，但这很难成为一件值得庆祝的事情。在同一天里，世界失去了一位伟大的球员。安息吧，科比。世界真的失去了一位伟大的人。在今天，我要纪念你，感谢我们之间的对战和友谊。”
FIBA国际篮联官方微博发布九图怀念科比，并配文写道：
有人说，人生可以分成24份
8份用来追逐理想
8份用来回击质疑
还有8份，用来单挑上帝
科比虽然不在了，但是他留给我们的精神却依然在，这种精神激励着一代又一代的年轻人努力奋斗。科比不是是一个球员，他更是一种精神的象征。虽然科比已逝，但曼巴精神永存。