在2008年5月26日，国务院批准设立了广西钦州保税港区，这是继上海洋山、天津东疆、大连大窑湾、海南洋浦、宁波梅山之后的全国第六个保税港区，也是中国中西部地区唯一的保税港区，体现了其在开放政策上的独特地位。
钦州保税港区作为海关特殊监管区，具有极高的开放程度，享有多种优惠政策叠加，如保税区、出口加工区、保税物流中心和保税仓。选址在钦州港金光工业园，规划面积达10平方公里，包括码头作业区、保税物流区、保税加工区和管理服务区四大功能区，拥有4.6公里深水岸线，计划建设10个集装箱泊位。
该港区分为三期建设，首期2.5平方公里在2008年启动，计划在2009年底实现封关运作，后续两期将根据港区发展需要逐步实施。钦州保税港区的目标是成为大西南的开放门户，中国-东盟自由贸易区的关键节点，服务于西南、华南和中南地区，辐射东盟，构建国际航运中心的重要组成部分。
广西钦州保税港区定位为北部湾经济区的核心开放平台，同时也是中国与东盟合作以及国际开放开发的重要平台，致力于建设成为亚太地区重要的国际物流枢纽和资源配置中心。设立的初衷是服务于西部大开发，推动中国与东盟的全面合作，完善保税港区体系，促进国际区域合作新趋势的形成，助力广西北部湾经济区成为西部大开发的战略高地和国际区域经济合作区。
钦州保税港区的发展目标明确，旨在立足北部湾，服务大西南，面向东南亚，通过高效运营、完善功能和高度开放，成为亚太地区的重要国际物流和资源配置中心。港区着重发展电气机械、精密仪器、电子信息等出口加工产业，以及电气机械、精密机械等为主的中转交易物流中心，还将发展为西南地区的汽车进出口基地，并积极发展国际中转、配送、采购和转口贸易等多元业务，以服务周边地区和东盟国家。
保税港区平均纵深约2.5公里，主要布局码头作业区、保税物流区、保税加工区和管理服务区4个功能区。深水岸线约4.6公里，规划建设集装箱泊位10个(8个10万吨级、2个5万吨级)，设计年吞吐能力640万TEU(折合6400万吨)。2007年，钦州港完成吞吐量1206万吨，增长58.3％。