微生物学（Microbiology）是生物学的分支学科之一，它是在分子、细胞或群体水平上研究各类微小生物（细菌、放线菌、真菌、病毒、立克次氏体、支原体、衣原体、螺旋体原生动物以及单细胞藻类）的形态结构、生长繁殖、生理代谢、遗传变异、生态分布和分类进化等生命活动的基本规律，并将其应用于工业发酵、医学卫生和生物工程等领域的科学。
概述
微生物的含义：非分类学上名词，来自法语“Microbe”一词。是形体微小、单细胞或个体结构简单的多细
胞、甚至无细胞结构的低等生物的通称。
种类：微生物类群十分庞杂，包括：无细胞结构的病毒、类病毒、拟病毒等，
属于原核生物的细菌、放线菌、立克次氏体、衣原体等，
属于真核生物的酵母菌和霉菌，单细胞藻类、原生动物等。
两界系统
动物界Animalia：不具细胞壁，可运动，不进行光合作用。
植物界Plantae：具有细胞壁，不运动，可进行光合作用。
三界：原生生物界Protista：（E.H.Haeckel,1866年提出）
五界系统
原核生物界Monera：细菌、放线菌等
原生生物界Protista：藻类、原生动物、粘菌等
真菌界Fungi：酵母、霉菌
动物界Animalia：
植物界Plantae：
五界系统是以细胞结构分化的等级以及和光合、吸收、摄食这三种主要营养方式有关的组织类型为基础的。六界：加上病毒界。
三界(域)系统
Woese用寡核苷酸序列编目分析法对60多株细菌的16SrRNA序列进行比较后，惊奇地发现：产甲烷细菌完全没有作为细菌特征的那些序列，于是提出了生命的第三种形式--古细菌(archaebacteria）。随后他又对包括某些真核生物在内的大量菌株进行了16SrRNA(18SrRNA)序列的分析比较，又发现极端嗜盐菌和极端嗜酸嗜热菌也和产甲烷细菌一样，具有既不同其他细菌也不同于其核生物的序列特征，而它们之间则具有许多共同的序列特征。于是提出将生物分成为三界（Kingdom）（后来改称三个域）：古细菌、真细菌(Eubacteria）和真核生物(Eukaryotes）。1990年，他为了避免把古细菌也看作是细菌的一类，他又把三界（域）改称为：Bacteria（细菌）、Archaea(古生菌）和Eukarya（真核生物），并构建了三界（域）生物的系统树。
微生物特点
1．体积小、比表面积大
微生物的大小以μm计，但比表面积（表面积/体积）大，必然有一个巨大的营养吸收，代谢废物排泄和环境信息接受面。这一特点也是微生物与一切大型生物相区别的关键所在。
举例：乳酸杆菌：120，000；鸡蛋：1.5；人（200磅）：0.3
2．吸收多、转化快
这一特性为高速生长繁殖和产生大量代谢物提供了充分的物质基础。
举例：3克地鼠每天消耗与体重等重的粮食；1克闪绿蜂鸟每天消耗两倍于体重的粮食；大肠杆菌每小时消耗2000倍于体重的糖；发酵乳糖的细菌在1小时内就可以分解相当于其自身重量1,000~10,000倍的乳糖，产生乳酸；1公斤酵母菌体，在一天内可发酵几千公斤的糖，生成酒精
3．生长旺、繁殖快
极高生长繁殖速度，如E.coli20-30分钟分裂一次，若不停分裂，48小时2.2×10^43菌数增加，营养消耗，代谢积累，限制生长速度。这一特性可在短时间内把大量基质转化为有用产品，缩短科研周期。也有不利一面，如疾病、粮食霉变。举例：Escherichiacoli（大肠杆菌）在最适的生长条件下，每12.5~20分钟细胞就能分裂一次；在液体培养基中，细菌细胞的浓度一般为108~109个/ml；谷氨酸短杆菌：摇瓶种子→50吨发酵罐：52小时内细胞数目可增加32亿倍。利用微生物的这一特性就可以实现发酵工业的短周期、高效率生产。例如生产鲜酵母时，几乎12小时就可以收获一次，每年可以收获数百次。
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