晋安区内平原山区各占一半，北部是福州盆地的外围北峰山区，南部为福州盆地的北半部。
晋安区的中部、西南部处于福州盆地的北半部；北部和东部的大部分地区处于福州盆地的北面和东北面。福州盆地北沿山岭大多是陡立山，自西向东连成一线，依次是新店的湖顶山（海拔601米，下略“海拔”、“米”）、新店与岭头交界的鲤鱼峰（606）、七星坪（598）和鼓山的屴崱峰（919）。
从西北部入境，向东南展布，成梯阶状下降，属中山地貌。中山山区包括日溪乡的点洋、汶洋、党洋、南峰、东坪；红寮乡的鹞山、长基、芹石、寿山、芙蓉；鼓岭乡的宜夏等。
晋安区丘陵分布广泛，一为北部山岭的前沿，一为散布在平原和岛屿中间的山丘。前者有新店的赤星、杨廷、涧田、后山、桂山，岳峰镇的登云，鼓山镇的潭桥、园中、东山、樟林、埠头等；后者有高盖山（202）、黄山（75.6）、金鸡山（85）、浮村山（41.8）、后屿山（25.6）等。汇入闽江的白马河、晋安河、磨溪、白眉溪等支流；北峰山区有日溪、桂湖溪等横流入连江县境，汇入鳌江。
主要山脉
鼓山：位于城区东郊，闽江北岸。海拔969米，面积1890公顷。西晋尚书郎郭璞在《迁城记》中就有“左旗（山）右鼓（山），全闽二绝”之赞。它因绝顶屴崱峰上有一巨石如鼓，每当风雨交加，便有簸荡之声，故名鼓山。从山麓的廨院登山，沿着左侧古道，登2145级台阶，经过七里七座亭便到山门；循右侧公路驱车盘旋约8公里，也可殊途同归。
鼓山胜迹以涌泉寺为中心，分东西南北四路，有160多景点。
长乐山：位于城区东郊长乐路东侧。据《闽县乡土志》载：长乐山又名白马山，其西北为芦提山、马崎山；迤南为三昧山、宝月山、东岳岭，又有前屿、后屿、横屿、茶园等冈。
康山：位于城区东郊。康山路东侧。据《闽县乡土志》载，该山有天香台，为古孝子进香祝亲处，旁刻有朱子所书“康”字，山因此名。
金鸡山：位于北环东路南侧。据《闽县乡土志》载，该山环麓为前岐头、水头、阪尾、溪口各村。迤北有青鹅山、桑溪。又北为鹅心峦、东湖山等。
寿山：在北峰山区，距城区38公里。与九峰山、芙蓉山鼎峙而立。山以出产寿山石而闻名中外。是雕刻印章及工艺品的上等材料。宋以后大量开采，今遗留有明清两代采石洞数个。 晋安区，境内雨量充沛年均温19.6℃，年降水量1342毫米，无霜期312天。
晋安区平原地区在1981年前的30年中，年平均气温为19.6℃，变幅为19.1℃～20.1℃。最冷月1月平均为10.5℃，最热月7月平均为28.2℃。1982～1990年9年中，年平均气温提高为20℃，变幅为19.4℃～20.5℃，气温渐有升高趋势。20世纪以来，极端最高气温为41.1℃，出现在1950年7月19日；极端最低气温为-4℃，出现在1940年1月25日。山区（北峰、鼓岭）年平均气温为17℃，变幅为15.9℃～18℃。1月平均为5.9℃，7月平均为24℃(1951～1976年资料)。沿海（琅岐）年平均气温为18.5℃，变幅为18℃～19℃。
