最初源于汉代医圣张仲景《伤寒论》所拟的两个方子：四逆汤和理中汤。到宋代《太平惠民和剂局方》才把两个方子合二为一。
四逆汤由制附子、干姜和炙甘草三味中药组成，理中汤则是温中祛寒，补脾益气的良方，它由干姜、人参、炒白术、炙甘草四味中药组成。附子理中汤实际上是在理中汤的基础上多了一味大辛大热的附子而已，附子被称为回阳第一要药。
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脾胃为后天之本，肾为先天之本，脾胃与肾相互依存，若脾胃阳虚日久，可致肾阳虚衰、温煦失职，除了腹泻外，还伴四肢冰凉、腹中冷痛等症状。
肾主一身之阳气，若肾阳不足，不能温煦脾阳，则见五更泄泻，下利清谷。故附子理中丸不但能温运脾阳，补中益气，且利用附子温热善走，偏补下焦命门阳虚之全阳之气，驱走体内寒气，温补脾肾以止泻，恢复脾胃升阳降浊的功能。
参考资料来源：人民健康网--脾肾阳虚腹泻服附子理中丸
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