杭州市萧山区第一人民医院的科室特色鲜明，涵盖了妇产科、神经内科、消化内科、心血管内科、肾脏内科以及中医科等多个领域。
妇产科自1950年起发展，设有产科和妇科，现有123张床位，其中48张为妇科床位，75张为产科床位。科室技术力量强大，配备有先进的设备，如妇产科手术室、多功能产床和各类监护仪。作为全市妇产科急救中心，成功应对多种复杂妊娠疾病。
神经内科创建于1990年，是萧山区最大的神经内科专科，擅长脑血管病和昏迷等疾病的救治，每日门诊量稳定，年住院人次和专科门诊量居省内前列。
消化内科作为独立科室，拥有高端电子内镜和先进诊断设备，治疗消化系统疾病处于国内先进水平，尤其在消化道出血、肝硬化等方面技术精湛。
心血管内科是医院的重点科室，专长于心血管疑难危重疾病的救治，心血管监护设施齐全，是医疗、教学和科研的综合科室。
肾脏内科是医院的重点专科，拥有30台进口人工肾机等设备，年透析病人量大，对肾病治疗经验丰富，包括移植手术和各种替代治疗技术。
中医科设有多个专科，如内科、针灸科和中医妇科等，有丰富的中医治疗慢性病和疑难杂症的经验，且注重中西医结合治疗。
儿科医院设有儿科门诊和病区，以及潜能开发中心，专注于儿童智力开发和疾病救治，设备先进，抢救成功率高，尤其在新生儿监护方面有显著成果。
杭州市萧山区第一人民医院创建于1935年8月，是萧山区的医疗中心和医学技术培训中心。目前为国家三级乙等综合性医院、浙江省文明医院、杭师院医学院附属医院、浙江省高等医学院校教学医院、浙医一院协作医院、上海华山医院萧山分院、浙江省肿瘤医院协作医院，与美国纽约州立大学医学院、德国切瑞特医院、澳大利亚玛太医院建有友好合作关系，是浙江省、杭州市、萧山区三级医保定点医疗机构。