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r语言芯片数据txt格式怎么读取
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推荐答案 2014-12-02
读åæ°æ®ï¼ä¸è¬ææ°æ®æ件æ¾å¨å·¥ä½ç®å½ä¸é¢ï¼ç¶å使ç¨å½ä»¤ï¼read.table("data.txt")å°±è¡äºåã
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r语言芯片数据txt格式怎么读取
答:
读取数据
,一般把
数据文件
放在工作目录下面,然后使用命令:read.table("data.
txt
")就行了呀。
基因
芯片
信号检测与
数据
处理(详细版)
答:
Ratio=(CH1I-CH1B)/(CH2I-CH2B)
芯片数据格式
下列为表达谱矩阵的一般格式:每一列为一个样本(sample)的所有基因表达值,每一行为某个基因在所有样本的表达值 原始数据呈偏态分布对数转化后呈近似正态分布 去除表达水平是负值或很小的数据或明显的噪音数据过闪耀现象物理因素导致的信号污染(划伤,...
芯片数据
的标准化方法(2002年文献)
答:
仅仅用Global标准化方法不能有效消除这些误差,并且重复组
数据
之间可能有不同的spread,需要进行scale校正以防止一个较极端的实验的结果对其他重复组的结果有太大的干扰。标准化包括(1)同一
芯片
内荧光强度的标准化(2)多个不同芯片之间的标准化(3)dye-swap(荧光交换)芯片的标准化【dye-swap实验为配...
如何
通过一致性聚类实现对表达谱
数据
的亚型分类
答:
1 准备表达谱数据集 首先准备一个基因表达矩阵,将它
读入
到
R
中。可以是转录组(如RNA-seq,
芯片数据
等),也可以是定量蛋白组,或者蛋白磷酸化、糖基化等修饰。具体以哪种类型的数据为主,根据实际关注的问题来。如果您更期望使用转录组进行分型,就使用RNA表达谱;如果您更期望使用蛋白组进行分型...
应用
R语言
做生物信息学分析,需要学哪些东西
答:
R
可以完成: 1、处理一些简单的有
格式
的文本数据,包括矩阵等 2、画一些简单的统计图,比如直方图,箱线图等 3、分析一些专门的数据,比如
芯片数据
,RNA-seq数据等 4、画一些专业的图,比如热图之类的
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