国家实物地质资料馆承担着不断完善全国实物地质资料服务组织体系的任务，国家实物地质资料服务体系的建立是国家实物地质资料馆开展服务的基础和保障。由代表政府的国土资源部矿产资源储量司负责全国实物地质资料服务的管理职能，具体由中国地质调查局所属的国家实物地质资料馆实行全国的管理服务职能，国家实物地质资料馆对中国地质调查局所属的各地质调查中心及各省、各行业政府主管部门指导工作。中国地质调查局所属的各地质调查中心对本辖区内实物地质资料管理服务工作负责，各省、各行业政府主管部门对本省或本行业所属的实物资料管理部门负责。目前，除中国地质调查局关于实物地质资料管理职能较为明确外，其他层次的组织体系尚未完善，如图5.2所示。
图5.2 实物地质资料服务组织体系