跨物种妊娠一般只能在亲缘关系较近的种系间进行，然而由于人类的特殊性，可供人类的选择并不多，人科动物都在进化中灭绝了，如今只有人类这一种，最多算上黑猩猩。
妊娠，从精卵结合到胚胎的发育的全过程都需要母体的支撑。异种妊娠第一个难题是受精卵着床，在受精卵着床之前母体子宫内膜需要增生最好妊娠的准备，而着床时也会引发免疫反应，异配生殖（一个配子大一个配子小，就像人类精卵体积差别很多倍，精卵结合是精子融入卵子）就是为了保证受精卵表面物质更接近母体体细胞，以便将遭受的免疫排斥降到最低。无法着床对于现代的人类来说就不能催动妊娠过程，人类还没有掌握受精卵的全体外发育技术，人工胚胎也是在囊胚早期就赶紧植入子宫内膜。
第二个问题是胚胎发育。胚胎的发育过程毫无疑问也需要生物生理环境的适应，需要激素和胚胎相互作用，而激素发挥作用的方式正是激素分子通过细胞表面抗原和细胞的结合，激发细胞的电生化反应，不同物种体内或许有相同的激素，但是也有不少激素存在氨基酸序列的差异，会导致激素效能的差异，进而难以保证胚胎的发育。
而另一个问题是血型，血型也是由于细胞表面物质，不同的生物具有不同的血型分类，虽然有血液胎盘屏障的作用，母体和后代的血液成分也存在沟通，Rh血型不合的妊娠，有可能发生死胎、早产和新生儿溶血症，而且也很少有生物像人类胚胎这样保持40周的发育。
只是针对这个问题的话，当然是有可能的，不过前提是要消除免疫排斥、血型不匹配、激素不配型等问题，可以通过对代孕动物的基因编辑实现，敲除一些不利于人类胚胎发育的基因。而且还有最后一个问题，跨物种妊娠还可能导致疾病的传播，每种生物生活经历不同，遭受的感染因素不同，每种生物都有自身的内源性比转录病毒基因（跨物种移植需要剔除此类基因），人类这类基因在体内占比未8%，生活中还会遭受更多的外来微生物影响，跨物种妊娠很容易造成个体先天虚弱，出生后很快死亡。
跨物种妊娠有一定的应用价值，目前可能主要用于克隆研究、复苏即将灭绝的物种等少数方面，但是人类的跨物种妊娠目前仍是想都不能想的事情，并不是说做了会导致什么危机，而是伦理道德等方面对设计人类的实验还是持比较谨慎的态度，一切涉及人的生物学实验都有比较严格的程序。
而克隆动物用上跨物种妊娠相对没那么多束缚，克隆技术可以促进人类对细胞全能性的研究，涉及的伦理道德问题也不像直接人体实验那么强烈。而跨物种妊娠会面临很多生理学难题，目前大概只能实现关系较近物种的繁衍，如用家猫孕育野猫的受精卵。
虽然人类尚未尝试过跨物种妊娠，但是已经试验过一些胚胎融合实验，将人类的细胞导入动物的胚胎，胚胎发育会导致人类细胞在动物细胞组织间的分布，此前日本进行过人和其他动物的嵌合体胚胎实验，大多数样本在妊娠期就死亡，有幸生产下来的也很快死亡；我国进行的猪猴嵌合体的研究也是类似的结果。