深交所和上交所当然是竞争关系，但是实际上各有侧重，好坏不易评判。
深交所和上交所上市的企业是不能二者都选择的，也就是说在深交所上市的公司不能在上交所进行上市交易，在上交所上市的公司不能在深交所交易，这也就奠定了二者之间的竞争关系。
上交所于1990年11月26日成立，而深交所则仅仅比上交所晚半个月时间，二者的建立时间都是如此接近。但是二者虽然是竞争关系，却有差异来规避成为完全同质的市场，让市场更加丰富、股民的选择更加全面。
首先，二者上市企业的侧重略有不同。上交所上市的企业一般是大中型企业,而深交所上市的企业则更多的是一些创业投资型的企业和中小微企业。
其次，二者的托管制度并不相同。上海证券交易所上市的股票只能托管在一家券商而深圳证券交易所上市的股票则可以在国家券商进行托管。
上海证券交易所实行的是全面指定股票交易制度，简单概括这一制度就是：自动托管，随处通买，哪买哪卖，转托不限。而深圳证券市场的投资者持有的证券只能在自己选定的证券营业部进行托管。
证券营业部负责管理其名下证券的明细资料，同时投资者的任何证券托管在任一证券营业部买入和卖出都自动托管在该证券营业部，投资者的卖出行为必须到证券托管营业部方可执行。
在两市成立的很长一段时间里，上市因为主要的大中型企业都在其上市，无论是市场成交量、还是市场融资额，还是投资者的参与热度都要远远优于深市。这是因为股票市场所上市企业的本质存在差异所导致的。
随着近年来深市的发展，我们发现，上交所的强势地位被悄悄撼动着。在2004年以及2009年分别深交所推出了中小板和创业板后，市场多数的IPO资源却逐渐聚集到深市市场。创业板市场迅猛崛起。
同时我国推行了注册制在科创板的试点，创业板市场的准入门槛持续降低，越来越多的初创企业进入到深交所当中，而这就如同一次新老经济之间的PK。深交所所代表的新经济充满活力，而上交所所代表的老经济根正苗红。
老经济根基的稳固和新经济活力的PK，一个是稳中求进的上交所，一个是风险与收益并存的深交所，就如同事业单位公务员和企业职员，不同的职业发展，就像象牙塔总有一个想出来也总有一个想进去。