1、自由交配我国在牧区的马群，绝大多数是采用自由交配，这是一种原始粗放的繁殖方法。公母马全年混牧，马群中马匹的年龄不等，甚至于未达配种年龄的马匹亦任其交配，以致配种缺乏计划性，育种工作不可能进行。由于交配不受约束，倘若母马无病，生活条件良好，受胎率亦可能不亚于其他配种方法。缺点为不适宜于有计划地进行育种工作。
2、小群交配这是较自由交配改进的配种方法，采取这种方法可以进行育种工作，因每一小群的马匹有一固定的公马，其后代血统不致混乱，而且不费很多的人力。即每到春季，将母马分成20～25匹的小群，并在每一小群内放入一匹指定公马在一起放牧。公马年龄以在5岁以上为佳，如系3～4岁的公马，每群母马应限制在10～15匹，并须适于群牧生活。如果公马特别强壮，饲养得法，母
马可酌量增加至35～40匹，其受胎率可达90%以上。小群交配的缺点是：由于母马数的限制，优秀公马的配种利用率亦受到限制。在小群交配中，公马凭其自己的喜好愿意和某些母马多次交配，而对个别母马不予理睬。应把凡多次被配的母马进行隔离，而把被忽略的那匹母马单独和这匹公马放在一马栏内，促使其达到交配的目的。
3、围栏交配在交配时把一固定母马群赶到设有圈栏的运动场，然后放入计划中早已指定好的某匹公马，如果群中有发情的母马即与之交配。交配之后，即将公马牵回厩内，以待下次交配，而母马群则放回原处放牧。此法是一种向辅助交配法过渡的形式，和小群交配同样适用于群牧条件下的配种工作，对采用良种公马用以改良地方马种甚为有效。一匹成年公马的配种负担约30～35匹母马，如管理得法，可达40匹以上。如果在牧群中，试情工作组织得很好，每次交配可不必把全群母马赶往圈栏运动场，只要确定有一二匹发情母马，可牵往该运动场内专配这些母马。
4、辅助交配辅助交配是舍饲养马普遍的配种方法。公马、母马经常分开饲养，母马在交配之前须经发情鉴定，交配当时且有人从旁给予必要的扶助。公马完全按照配种期的舍饲管理，并完全控制公马的交配，目的是使良种公马发挥高度有效的利用率。辅助交配法常应用于各养马场及配种站，要求地点固定、其地面平坦、环境寂静、围以土墙或篱笆，一面有门出入，其中设置交配架，其前方可设一幼驹栏，以便交配时收容幼驹，防止母马因见不到幼驹造成的不安定而妨碍配种。交配前把母马尾根部用绷带缠扎，拴在一侧，并给母马装上交配保定带或后蹄穿上配种鞋套以防其踢蹴公马。