公办二本高校与民办二本高校都是经教育部主管部门批准设立的，两者唯一的区别就是资金来源不同，公办院校办学经费来源于政府部门，而民办院校办学经费完全靠自筹。
1、公办二本高校与民办二本高校都是经教育部主管部门批准设立的，两者唯一的区别就是资金来源不同，公办院校办学经费来源于政府部门，而民办院校办学经费完全靠自筹。
2、公办二本大学的生源较好，而民办大学的生源较差。正规的大单位，尤其是国企，更看重名牌公办大学的学生。
3、只要是高考中统一报志愿,统一组织录取的，不论公办二本学校还是民办二本高校，其毕业证都是普通高校全日制毕业证，毕业证都是一样的，毕业待遇也是一样的，但民办的学费一般是公办大学的一倍左右，所以能上公办的最好。
1、学费不同
仅看“民办”和“公办”二字，就不难知道，民办二本的学费要更贵，一年学费大概在2万元上下，由于受城市经济发展，以及级别等因素影响，学费可能更高。
公办二本一年大概在5000元上下，因为有国家的财力支持，费用要少，所以，家长和学生要慎重考虑，如果家庭经济条件，真的不允许上民办二本，又没把握上公办二本，选择一所专业实力强的专科，未必是坏事。
经济上的差距，也会导致生活的环境不同，民办二本自然要更好一些，公办二本要朴素一些，但是，上大学是为了学习，不是为了享受，学生还是要多看院校和专业实力，以及发展前景。
2、教学质量差距也不小，尤其是师资力量
公办二本院校的教师待遇要更好，所以，会吸引更多优秀教师，很多老师是博士学历，民办二本一般多是硕士学历老师，老师实力不一样，就会导致教学质量上有差距。并且，公办二本的科研项目、含金量也较高，对学生的未来发展，有很大的帮助，过来人直言，学生尽可能地冲刺公办二本。
3、学习氛围不同，公办二本或更好一些
选择公办二本的学生，基本是学习比较强的学生，学习氛围会更好，学生之间能平等友好相处，民办二本的学生，很多家庭条件比较好，未来会接手自己家公司，或者出国留学，学习氛围可能就不是那么紧张，不太适合普通家庭学生报考。
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民办高校（大学）指的是企业事业组织、社会团体及其他社会组织和公民个人利用非国家财政性教育经费，面向社会举办的高等学校及其他教育机构，其办学层次分专科和本科。国家鼓励社会力量举办实施义务教育的教育机构作为国家实施义务教育的补充。国家严格控制社会力量举办高等教育机构。国家对社会力量办学实行办学许可证制度。各级教育行政部门按照规定的审批权限，对批准设立的教育机构发给办学许可证。
公立大学是指以国家政府或地方政府资助创立维持的大学，区别于以民间资本为主的私立大学。在世界上一些国家和地区（如中国），公立大学可选为重要的研究型大学。而有些国家和地区（如美国）的公立大学则不如许多私立大学具有声望及竞争力。
补充：
中国的民办高等院校与公办高等院校不同，民办高等院校一般由院校所在省、市、自治区的教育厅或教委主管，公办高等院校则由院校所在省、市、自治区级政府主管。
独立学院不属于民办高校的范畴，只是对民办高校的补充，有公立独立学院与非公立独立学院之分。