1、权利义务不同
法人企业可以以自己的名义独立享有法律权利，承担法律义务。也就是说，法律权利直接属于企业，而不是所有者或投资者。同样，法律义务由企业直接承担，而不是由所有者或投资者承担。
自然人企业为投资人个人所有，所得归投资人个人所有，企业的风险也由投资人个人承担；投资人投资于个人独资企业的财产和其它个人财产为不可分割。
2、类型不同
自然人企业是一种组织形式；
法人企业是有限责任公司、股份有限公司。
扩展资料：
自然人企业的特征：
1、自然人企业是自然人投资的企业。这一特征要求个人独资企业的投资人必须是自然人。投资形式为独资，即一人投资。
2、自然人企业的财产属于个人投资者所有。这个特性是由前一个特性决定的。个人独资形成的财产，只能由个人投资者所有，不得由别人所有。这就建立了自然人企业的基本产权关系，决定了其经营成果属于个人投资者。
3、自然人企业投资人以其个人财产对企业债务承担无限责任。这是因为自然人企业属于投资者个人所有，收入归投资者个人所有，企业的风险也由投资者个人承担；投资者投资于个人独资企业的财产等。个人财产是不可分割的，是企业清偿债务的基础，这种责任形式由个人成为个自然人企业。
4、自然人企业是一人投资的经营实体。也就是说，它必须是一个真正的实体，从事生产经营，能够享有权利和承担责任，而不是一个虚构的市场实体。
参考资料来源：百度百科-自然人独资
参考资料来源：百度百科-法人企业
2、法人企业是指取得法人营业执照、具有法人地位的企业。相对于非法人企业（如：个人独资企业、合伙企业、公司的分公司等分支机构等），法人企业能够以企业自己的名义独立享有法定权利和承担法定义务。也就是说，法定权利直接归企业享有而非企业业主或投资者，同理，法定义务也直接由企业承担而非企业业主或投资者。
温馨提示：以上内容仅供参考。
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人是社会组织在法律上的人格化，是法律意义上的"人"，而不是实实在在的生命体，其依法产生、消亡。自然人是基于自然规律出生、生存的人，具有一国国籍的自然人称为该国的公民。自然人的生老病死依自然规律进行，具有自然属性，而法人不具有这一属性。虽然法人、自然人都是民事主体，但法人是集合的民事主体，即法人是一些自然人的集合体。例如大多数国家(包括我国)的公司法都规定，公司法人必须由两人以上的股东组成。对比之下，自然人则是以个人本身作为民事主体的。法人的民事权利能力，民事行为能力与自然人也有所不同。据《民法总则》第规定，法人必须同时具备四个条件，缺一不可。(一) 依法成立。即法人必须是经国家认可的社会组织。(二) 有必要的财产和经费。(三) 有自己的名称、组织机构和场所。(四) 能够独立承担民事责任。
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自然人企业与法人企业究竟有哪些区别？