刘备不把诸葛亮留在荆州，是因为诸葛亮的作用法正没法取代的，刘备要夺取和控制益州，少了诸葛亮不行。刘备在刚入川时其实带的部队不多，在得到刘璋加强，又吞并了白水军以后也才3万多人。而且刘备只带了庞统、黄忠、魏延等人，把诸葛亮、关羽、张飞、赵云都留在了荆州。从这里可以看出，刘备把当时手下最主要的部下都留在了荆州。
刘备这个安排其实原因很简单，他入川以后并不是马上和刘璋翻脸，而需要时间熟悉一下川中情况，因此开始并不需要太强的力量。而荆州是自己的根本，必须留下足够可靠的人和部队守卫，所以他才会把诸葛亮等人和大部分部队都留在荆州。但是在他决定向刘璋动手以后，那么就要快刀斩乱麻，尽快解决刘璋，避免战事长期化。所以和《三国演义》不同的是，刘备不是在庞统死后才调诸葛亮等人入川，而是从葭萌关起兵以后，就直接命令诸葛亮、张飞、赵云等人从荆州率援军分路入川，和自己一起攻打刘璋。而此时除了庞统，法正也在刘备身边，荆州这一路张飞和赵云都是武将出身，诸葛亮显然不可或缺。
在夺取益州以后，诸葛亮的作用就更大了。在正史上，诸葛亮的政治才是他的最长项，而法正长于谋略，在内政上比诸葛亮差的多，刘备手下其他人也无法和诸葛亮媲美。因此在刘备夺取益州以后，诸葛亮又开始协助刘备整理益州的政务，加强对益州的统治。像治理益州的律法《蜀科》就是诸葛亮主持起草的，而因为《蜀科》过于严厉，法正一度还提出反对意见，诸葛亮则以《答法正书》阐明了实行严法的必要性。从事后的结果看，诸葛亮的决定是对的。也正是靠了诸葛亮，刘备才能在短时间内巩固了在益州的统治。而在刘备和曹操在汉中大战时，也是诸葛亮留守益州，调度军需粮草，发挥了极大的作用。相比之下，刘备在荆州经营多年，并不需要诸葛亮去稳定政局，所以刘备不可能把诸葛亮调往荆州协助关羽。倒是如果庞统不死的，法正和庞统中一人可以调到荆州协助关羽处理军务。
