晚上刚听到一件事情很是气愤，请在行的朋友给分析一下。
我有一个朋友因和公司有矛盾辞职不干了，公司却扣除一个月工资不发（2000元），当时有一个中间人（公司以前的合伙人）出面调解，意思就是说算了，出于给中间人面子，不想断了与中间人的交情，便息事宁人。当天算是话都说清楚了，也办好了离职。
可今天有意外发生了，公司竟然扬言要告我朋友！说他挪用公款！
因为他是公司工程师，在公司2年多是负责安装，售后和维修工作。按公司规定是要他签名领配件的，等安装好了，店里付钱，然后到财务交钱。
可是现在问题出来了，公司讲他从店里收的钱没有交到财务，而当初交钱的时候，公司也没让签字说明已收到货款。
公司财务一直很混乱，有些货款是先签单一个月后才付钱，直接付公司的，还有些是老板自己答应赠送的，现在全部都算在他身上。
这是一个家族型公司，财务，库管都是自己亲戚在做，公司说帐上有问题，那别人也看不到。
所以问问专业人士，像这样的情况应如何处理。
还有给公司交货款的时候，公司没让交款人签字说明已收到货款。这要怎么证明已交了钱呢？
随便了解一下挪用公款会有怎样的法律责任，谢谢。
公司的帐目算不算证据，他们口中讲的“挪用公款”是单方面说，并不知道多少钱？现在并没有起诉，请问遇到这样的事情应如何处理？