1、使用方法
(1)可采用穴施或沟施的方法将菌肥施入土壤中
(2)需要注意的是，一般情况下，只有在菌群聚集后才能达到更好的效果。因此，不宜冲施或撒施菌肥，以免菌群分散，造成施用效果不佳。
2、使用注意事项
(1)菌肥不能与杀菌剂混用，因为它容易消灭活性细菌，使菌肥无法发挥原来的作用。
(2)如果在温室中使用，需要注意不要有
紫外线灯，因为紫外线也会消灭生物活性菌。
(3)施用菌肥后，要合理灌溉，晴天上午轻灌为宜。浇水后要适当锄地，增强土壤通透性，提高菌肥的施用效果。施用后浇水的原因是生物菌大部分是好氧菌，通常在干湿土壤中都有活性，所以浇水可以使生物菌更加活跃。