很多药物的药理作用是互相对抗的，如中枢神经兴奋剂和中枢抑制剂、升压药与降压药、血管紧张剂与血管扩张剂、泻药与止泻药、扩瞳剂与缩瞳剂、抗凝血剂与止血药等。另外，两种具有相同作用的药物配伍后往往也会产生不良后果。如阿的平与伯氨喹啉同为抗疟原虫药物，但两者配伍后，前者使后者从血中排除的速率减慢，从而增加其毒性反应。又如已经洋地黄化的病人，又一次给了大剂量的钙剂，就有可能引起洋地黄中毒。其他还有叶酸与苯妥英钠、呋喃妥因、氨苯蝶啶等配伍，四环素与钙剂配伍，青霉素与氯霉素、四环素、红霉素等同时静点，都能引起药物失效或降低效力。