法律分析：考上公务员三方违约金是否需要支付应当根据具体情况而定，一般情况下，如果是公司解除了三方协议，则不需要支付违约金。如果没有就业单位提供专项培训、约定服务期，从业人员无须承担违约责任。劳动合同法上规定的违约金只有两方面，即违反服务期约定的违约金和违反竞业限制义务违约金，除此以外，不允许设定违约金，即便设定，也因违法而无效。
大学生在上学时与公司、学校签订了三方协议，而毕业后考取了公务员，则希望放弃三方协议的条款，那么在法律上是必须要交纳违约金的。需要注意的是，三方协议是公司、学生、学校为了就业而签订的具有合作意向的协议书，并不是劳动合同，可以就协议的相关条款提供意见导致协议失败来进行。
法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》
第三条 订立劳动合同，应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。依法订立的劳动合同具有约束力，用人单位与劳动者应当履行劳动合同约定的义务。
第十条 建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。已建立劳动关系，未同时订立书面劳动合同的，应当自用工之日起一个月内订立书面劳动合同。用人单位与劳动者在用工前订立劳动合同的，劳动关系自用工之日起建立。
第三十六条 用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。