基因工程在各个领域展现出了强大的应用潜力，从农牧业到食品工业，再到环境监测和医学治疗，其影响深远。以下是基因工程在不同方面的具体应用：
农牧业：通过基因改造，科学家培育出生长快速、适应恶劣环境、产量高的转基因鱼（中国），如转基因牛能产生含有人生长激素的乳汁（阿根廷）。此外，还有抗病的转基因作物，如转黄瓜抗青枯病的甜椒、转鱼抗寒基因的番茄，以及抗虫棉，利用苏云金芽胞杆菌的基因合成抗虫成分。
环境保护：基因工程应用于环境监测，如D优红NA探针可灵敏检测环境污染。指示生物被用来反映环境污染，它们能吸收和转化污染物，甚至培育出能分解多种污染物的“超级细菌”。
医学领域：基因治疗是基因工程在医学的重要应用，旨在替换或补救缺陷基因，治疗单基因遗传疾病。例如，将正常基因导入体内治疗糖尿病和病毒感染，如基因工程胰岛素和干扰素。然而，基因治疗仍处于初级阶段，安全性与有效性有待提升。
医药卫生：基因工程药品生产解决了传统药物产量低、成本高的问题，如大规模生产胰岛素和干扰素。基因诊断与基因治疗则用于检测遗传病和遗传缺陷，如肝炎病毒，以及针对SCID等严重免疫缺陷病的基因疗法。
尽管面临技术和伦理挑战，基因工程的潜力和前景依然广阔，它正在推动医学领域的革命性变革，并为人类健康和环境保护带来实质性的贡献。