1993～1994年，新疆地矿局开展的第二轮重点地区1∶20万成矿区划研究工作，对新疆及本区的贵金属和有色金属重要矿种的成矿区带、成矿规律、找矿模型等进行了深入分析研究，并在本区共圈出重要成矿带12个、找矿远景区34个，提出主攻矿种为铜、金、铅锌及其他有色金属。
1995年，新疆国家305项目办公室组织陕西地矿局物化探大队、西安地质学院采用1∶20万网格数据、36km2网格窗口进行滑动平均编制完成阿尔泰地区、西准噶尔地区、东准噶尔地区、西天山地区1∶150万地球化学图并进行了综合研究和数据库建设。
1995～1998年，新疆地矿局针对39种元素的260万个原始数据，采用1∶20万图幅为单元、以各个元素为对象采用线性系数校正法进行全区统一调平方法完成了新疆境内北纬41°20'以北1∶300万地球化学图编制，并从宏观上研究新疆北部地表多种元素含量分布和浓集特征。
2001～2003年，新疆地质调查院完成了《新疆地球化学块体内矿产资源潜力预测研究》。对Au、Ag、Cu、Pb、Zn等14种主要成矿元素进行了地球化学块体圈定和研究，划分单元素地球化学块体322个，剖析了重要地球化学块体的内部结构，详细对比研究了地球化学块体与已知矿床的对应关系，对地球化学块体内的资源潜力进行了深入分析和综合排序，圈定成矿远景区42个。
20世纪80年代开始，新疆地矿局、国家305项目办公室以及其他科研单位，相继开展并完成了一大批包括本区在内的新疆区域性成矿地质背景、成矿规律以及矿床成矿系列和成矿模式等综合性科研工作。
上述工作，建立了研究区地质构造格架，总结了区域成矿和区域地球化学元素分布规律，为开展矿产资源评价工作奠定了的基础。