苦瓜的主要病害有猝倒病、白粉病、炭疽病、枯萎病、蔓枯病、褐斑病、细菌性角斑病、霜霉病、疫病、病毒病等。其防治方法要在合理轮作的基础上，加强田间管理。如：在采收期间注意做好田园清洁，彻底清除遗留在田间的枯枝败叶，病株残体，同时，注意合理施肥和灌排水，在发病初期及时喷药，以防病害的扩展，
一、猝倒病
1、主要症状
此病为真菌性病害，猝倒病在幼苗出土不久最易发生。初时幼苗幼茎基部呈水浸状，而后病部变淡褐色，幼苗近地面处明显缢缩，子叶尚未凋萎而倒伏。土壤温度低，湿度大时有利病菌的生长与繁殖，所以一般夜晚凉爽、白天光照不足、苗床湿度大时发病严重。
2、防治方法
①苗床消毒：种植前用70%五氯硝基苯与50%福美双于植沟中进行土壤消毒处理。②药剂防治：可用72.2%霜霉威盐酸盐750倍或用灵·代森或58%甲霜灵·代森锰锌或75%百菌清600倍或32%甲霜·恶霉灵300倍液喷于幼苗基部。
二、白粉病
1、主要症状
此病为真菌性病害，苗期至收获期均可染病，以叶片发病较重，果实则很少发病受害。发病初期叶面或叶背上产生白色近圆形星状小粉斑，以叶面居多，后向四周扩展成边缘不明显的连片白粉，严重时整叶布满白粉。病害由植株下部老叶往上发展，发病后期，白粉变为灰色，病叶枯黄，但一般不脱落。温度和湿度是影响发病的重要条件，温度在16-24℃和湿度较大的条件下，病害易于流行、发病也重。高温干旱的气候环境病害发生较轻。
2、防治方法
药剂防治：可喷①15%三唑酮（粉锈宁）乳油1500倍液；②12%腈菌唑可湿性粉剂2000倍液；③50%硫磺悬浮剂250倍液；④翠泽悬浮剂800倍液。其技术要点是早预防，并做到叶面叶背均匀喷药，严重时须联合2-3种药剂，隔5-7天1次，连喷2-3次。
常见虫害
1、瓜实蝇：幼虫孵化后钻入瓜内取食，受害瓜先局部变黄，而后全瓜腐 烂变质，内有蛆虫蠕动，造成大量落瓜，即使不腐烂，瓜畸形下陷，品质下降。
防治方法：①最有效的方法是诱杀成虫，可将香蕉皮用敌百虫浸后悬挂在 瓜棚下，也可用甘薯煮熟发酵加敌百虫和少许香精用容器盛装悬挂棚内， 每亩放20个点，每点约放半两，可诱杀成虫。②清除烂瓜，深埋或焚烧。 ③虫害发生重时，采用纸袋套瓜保护，防止成虫刺瓜产卵。④采用药剂中 午或傍晚喷杀成虫，可选用以下药剂：1.8%阿维菌素乳油2000-3000倍液，或40%毒死蜱1500-2000倍液，或2.5%敌杀死2000-3000倍液喷施，每隔3-5天喷一次，连喷2-3次。
2、红蜘蛛：主要危害叶片，刺吸汁液，使叶片失绿黄化，植株早衰，幼瓜不能膨大，造成间隔开花结瓜和幼瓜畸形，缩短采收期，降低产量和品质 。
防治方法：在苦瓜生长发育期间，注意检查叶片，如果发现有粉红色针头大小的幼虫吸附在叶片上，要及时喷洒药剂防治，每周喷洒1次，连喷2-3次。有效药剂有：丁氟螨脂、联苯肼酯、乙螨唑、噻螨酮、螺螨酯、阿维菌素、克螨特等交替使用。
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一、加强肥水管理，培养健壮的植株，提高抗病能力
及时疏松土壤，注意各个生长时期的水肥匹配供应，并喷施新高脂膜，保墒保肥效防水分耗散，确保植体有一个良好的、长环境和条件。
二、及时预防，防治结合
结合生产季节和天气变化，及时用药，并加施新高脂膜增提药效，防病虫侵袭和有效灭杀病虫。
三、壮蒂壮果，提高产量
在苦瓜开花前、幼果期、果实膨大期喷洒壮瓜蒂灵能使瓜蒂增粗，强化营养输送量，协调营养平衡，促进瓜体快速发育，使瓜型漂亮、汁多味美。同时在瓜面喷洒新高脂膜可起到液膜套袋作用，不会影响果实呼吸，防果锈病，防裂果，提高果面着色和光亮度，降低残毒提高品质。
苦瓜易得白粉病。枯萎病，夜蛾。
主要有斜纹夜蛾、甜菜夜蛾，瓜实蝇。
苦瓜的主要害虫有蚜虫，甜菜夜饿等。