如何确定基因的内含子和外显子序列及基因结构图

如题所述

如何确定基因的内含子和外显子序列及基因结构图
1、首先输入基因的完整学名,找到与基因相关的cDNA序列.在这一cRNA序列的解说信息里,就已经有各外显子的分节.
2、将该cDNA输入Blast进行序列比对,就可以找到其每一个外显子所对应的染色体位置,这些信息就显示了所有的外显子.处于外显子两端的序列就是内含子.
3、如你需要完整的基因序列,需要在blast中选择others这个数据库,然后查找相关的Bac质粒中含有你完整基因的文件,在其中找到你所需的信息.
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第1个回答  2020-03-10
基因的全序列是么?
ok
进入ncbi,选中mapview选择项。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/
输入你要下载的基因名称和物种。
举个例子,我要下载小鼠的igf2基因。
先在下拉菜单中选mus
musculus(小鼠的拉丁文),
for后面填写igf2基因(你要什么基因就自己填,我这随便写一个)。
会进入一个界面,ok。
就会出现相关界面。在下面找到download,你要下载什么样的序列自己看!
一般是refseq
然后进入另外一个界面。在输出格式里选择fasta(只有序列)或者genebank(除了有序列,还有基因的英文介绍)格式。
ok,你可以下载了。
我想回答够清楚了。希望你有用。
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