在使用水质分析仪时，有几点关键注意事项需格外留意:
首先，确保系统的密闭性至关重要。卡尔-费休试剂的液路连接应紧固，从试剂瓶到计量泵再到反应池，任何泄露都可能影响测试结果。由于试剂会吸收空气中的水分，不密闭的系统可能导致滴定终点延迟。
其次，取样精度不可忽视。在标定试剂时，推荐使用10ul的取样器提取10mg水，这样既准确又快速，可以防止水滴粘附。同样，取放甲醇试剂和乙酯时也应迅速，尽量缩短反应池打开的时间。
再者，磁性搅拌速度的调整也影响着测试效果。在反应池中，搅拌速度应调至刚好避免形成湍流，以确保快速达到滴定终点。
滴定速度的设定也很重要，开始时应快速，接近终点时减慢，这样可以提高计量的精确度。实验结束后，务必排空系统中的卡尔-费休试剂，并用甲醇彻底清洗，避免使用水，因为水不易挥发，可能影响下次试验的标定准确性。
水分测定仪应远离强磁场以防止显示干扰。对于手动仪器，由于需要使用玻璃滴定管，其平衡压力要求与外界接触，这时U型管中填充的干燥剂能减少空气水分对测试的影响。在湿度较高的环境中，应避免进行水分测试。
最后，调整滴定速度时，推荐每秒1滴，过快会导致终点延时误差增大，过慢则会延长测试时间，增加干扰，影响终点的到达。
为了保护水环境，必须加强对污水排放的监测。检测点的设计和检测仪表（主要是水质分析仪）的质量对水环境监测起着至关重要的作用。用化学和物理方法测定水中各种化学成分的含量。水质分析仪分为简分析、全分析和专项分析三种。简分析在野外进行，分析项目少，但要求快而及时，适用于初步了解大面积范围内各含水层中地下水的主要化学成分专项分析的项目根据具体任务的需要而定。另全自动离子分析仪可快速而准确的定性定量分析，并可全自动、智能化、实时在线、多参数同时进行分析。