据了解，科学家正通过一种全新的分析比较现代人类与古代人类DNA的方法，绘制人类的基因树，并且已经取得一些新进展。现代人类(智人)似乎更早和更频繁地与一个古老的人类祖先进行过交配。他们还发现了这位神秘的远古人类祖先的DNA，仍然是我们现代人类遗传基因的一部分的证据。
一支来自美国顶尖大学的美国科学家团队，开始了一项雄心勃勃的计划，以绘制不同种类原始人之间的基因流动图谱。基因流动是古代人类物种间杂交的一个标志。梅丽莎简·胡比斯(Melissa J. Hubisz)为了实现这个项目的目标，开发了一种名为ARGweaver-D的新算法。这种算法使研究人员能够开发出一个早期人类基因树的模型。
据《生活科学》杂志报道，参与这项研究的亚当·西佩尔表示，“我们正试图建立一个完整的模型，用来研究所有被分析的个体的基因进化史。”
通过DNA研究发现神秘的远古人类祖先
在研究中，研究人员比较了两名尼安德特人、一名丹尼索瓦人和两名现代非洲人的基因组。尼安德特人(Homo neanderthalensis)是一种已经灭绝的人类物种，大约在3万年前灭绝，曾经居住在欧亚大陆的大片地区。丹尼索瓦人是一个神秘的物种，只有通过他们的DNA才能知道，他们可能分布在西伯利亚和东亚地区。之所以选择现代非洲人作为样本，是因为我们知道他们没有尼安德特人和丹尼索瓦人的基因。
基于突破性的算法，研究人员能够开发一个远古祖先的"基因树"，基因会以树形记录和反应出每个个体之间的关系，以及组合变化的趋势。研究小组尝试建立一幅人种间广泛杂交的图像，同时对他们的迁徙模式也有了深入的认识。
研究人员在《公共科学图书馆•遗传学》(PLOS Genetics)杂志上写道，他们估计基因流动发生在20万或30万年前。研究表明，现代人类（智人），丹尼索瓦人，尼安德特人在远古时期进行过杂交。然而，使用新的算法，研究人员能够证明这种杂交发生的时间比以前认为的要早得多。
从解剖学角度来看，现代人很可能是在早期的一波波中离开非洲，迁移到欧亚大陆，并在尼安德特人返回非洲或灭绝之前与他们交配。
网站Inverse.com指出，“基因组包含的遗传物质来自一个意想不到的来源——一个既不是人类，也不是尼安德特人，也不是丹尼索瓦人的远古人类祖先。”这是一个谜。研究人员推测，这些基因可能来自直立人。直立人是大约200万年前出现在非洲的已经灭绝的古人类，是第一个使用火并从非洲迁徙出来的古人类。
神秘的直立人
然而，直立人的“故事”尚未得到证实，因为我们没有任何来自这个早已灭绝的人类物种的DNA。西佩尔对《生活科学》杂志说:“那个灭绝的人类物种的基因组从未被测序过。因此，关于人类的进化我们还有很多不知道的地方，包括直立猿人是否是我们的祖先。在基因组序列中发现的“嵌套”的神秘DNA也有可能来自一种新的未知的远古人类祖先物种。
最新的研究表明，人类的基因树比最初想象的要复杂得多。几十万年前，有四种人类，他们进行了杂交。看来，我们的远古人类祖先的范围是重叠的，而且由于他们的定期迁徙，他们经常与不同的人类物种交配。这项研究还显示了移民在古人类和现代人类进化中的重要性。
现代人类是多个杂交后代的结果
西佩尔告诉《生活科学》杂志，“一系列不同但有关联的种群在全球迁徙，经常相互影响，偶尔发生的杂交事件产生杂交后代。目前尚不清楚这些杂交品种是否适合生存和繁衍后代。似乎至少有一些幸存了下来，这就解释了为什么许多群体具有独特的基因遗传。例如，西藏人和太平洋岛民身上有丹尼索瓦人DNA的痕迹。这些杂交事件在现代人类的进化中非常重要。
