root权限获取后，并不是马上应用到所有手机上的应用的，而是当应用运行后，使用到需要root权限时才会激活对对应软件进行roo权限的获取。以RE管理器为例，
1. 在“挂载为只读”模式下，RE管理器是不需要root权限的。
2. 只有首次“挂载为读写”时，才会触发RE管理器获取root权限，这样才会在手机的root权限管理中找到RE管理器。
3. 打开手机安全中心--权限管理--ROOT权限管理，就可以看到RE管理器在申请列表中了。
4. 点击打开后，根据提示向导完成后，就可以获得root权限。
5. 返回RE管理器软件界面，再次点击“挂载为读写”就切换过来了。
就是软件没跳出申请对话框啊。
直接说我没root
重启试试？
嗨！
建议你先备份你的重要数据，然后进行线刷完整包（推荐你刷到最新开发版）后再使用查看是否还有你描述的问题。
可以根据刷机教程进行刷机，其中第六种方式为线刷：http://bbs.xiaomi.cn/thread-3104435-1-1.html
同时请你下载你手机适合的线刷包：http://rom.xiaomi.cn/
这是米粉制作的刷机视频：http://v.youku.com/v_show/id_XNTEyMjQ1MzI4.html
是这个吗？
追答root权限管理
追问
点开root权限管理就是这样子
追答说明没有程序要root，
当有程序用时候，会出对话框的。
没事，求好评。
追问
就拿360卫士来说吧。点开后就没有弹出对话框。然后点了里面的＂恶意广告拦截＂功能，上面显示获取root失败。
追答没出对话框？允许了吗？
追问直接没出对话框
追答或者你刷机没好，三清过了吗？
追问什么叫三清？
追答
给我来个系统更新截图
给我来个系统更新截图
追问
一样的版本
追答重启到Recovery，就是清除手机上所有数据，刷机前必做。
追问清了
追答呃。。重启下试试
追问我刚刚又用360的一键root刷了次机。把问题解决了，在桌面上生成了360的授权管理图标，用这个可以进行软件的root授权。。不过自带的授权管理仍无反应。太奇怪了
追答无所谓了，反正问题解决了。
终于，我等你满意答案花都快谢了
本回答被提问者采纳去修手机的地方