子宫内膜异位囊肿的治疗方法主要包括手术、药物、介入和辅助生育治疗，目的是消除病灶、缓解疼痛、促进生育并减少复发。治疗时需考虑年龄、生育需求、症状严重性等因素，治疗需个体化并规范化。
早期治疗和控制病程发展是关键，可通过西药假孕疗法和中医中药治疗，后者强调通过调节内分泌等机制改善生殖系统功能以提高受孕率。手术治疗是主要手段，腹腔镜下手术能明确病灶，对盆腔疼痛、不孕和包块有良好效果。手术类型包括保守性、半根治性和根治性，取决于患者生育需求和病变严重程度。
手术前要充分准备，理解手术风险和可能的并发症，如肠道和泌尿系统的损伤。深部浸润性内异症可能需要辅助性手术，如神经切除术。药物治疗包括抑制卵巢功能的药物，选择时需考虑副作用和个人条件。对于难以切除的病灶，可能需要术前药物预处理。
对于不孕患者，全面检查不孕原因，轻度内异症可能通过药物或手术结合辅助生殖技术来提高受孕机会。手术时注重保护生育功能和正常组织，术后再根据病情决定是否需要后续药物治疗。
子宫内膜异位症（内异症）是指子宫内膜组织（腺体和间质）出现在子宫体以外的部位，其特点如下： 生育年龄妇女的多发病，主要引起疼痛及不孕；发病率有明显上升趋势；症状与体征及疾病的严重性不成比例；病变广泛﹑形态多样；极具侵润性，可形成广泛、严重的粘连；激素依赖性，易复发。