工业“三废”的排放和农药、化肥的大量使用是造成果园土壤、灌溉水源以及果品重金属污染的主要污染源。有害重金属主要包括镉、铅、汞、铬和类金属砷等，这些重金属对人体和动植物均有不同程度的毒害作用。
（1）镉 镉的污染源主要来自金属矿山、金属冶炼厂和以煤为原料的电镀、电机、化工等工厂。这些厂矿排放的“三废”中都含有大量的镉。镉是一种毒性很强的金属，已被列为世界八大公害之一，它对人和生物的毒害很大，而且可在人体内长期积累，生物半衰期长达20～40年。镉易引起人体急、慢性中毒，并有致癌、致畸作用。急性中毒主要损害人的肺、肾等重要器官。慢性中毒主要是镉在人体内积累到一定数量时造成的，潜伏期为2～8年，主要损伤人的神经和关节。
（2）砷 砷的污染主要来自造纸、皮革、硫酸、冶炼、农药、化肥等工厂排出的废水和废气。煤炭中含有一定数量的砷。据测算，每消耗1吨煤即能挥发出2.5克砷进入大气，因此，以煤为能源的工业和民间燃煤也是一个重要污染途径。另外，含砷的化学农药如福美胂、砷酸钙等也会造成一定的污染。砷对植物的危害主要是阻碍水分和养分的吸收，无机砷影响营养生长，有机砷影响生殖生长。砷对人的毒害更大，砷可与空气中的氧结合形成三氧化二砷（砒霜），砒霜与人体内的蛋白酶结合，可使酶失去活性，导致细胞死亡。人的急性砷中毒表现为胃肠炎症状，如腹痛、呕吐，甚至失水虚脱而死亡。慢性砷中毒主要引起浑身酸痛、腹泻、恶心、呕吐、肝肿大，并能引起多发性神经炎。同时，砷还是肺癌、皮肤癌的致病因素之一。
（3）汞 汞在自然界广泛存在，它可以分为金属汞、无机汞和有机汞化合物。污染源主要来自矿山、汞冶炼厂、化工、印染、涂料等工厂排出的“三废”以及农业上的有机汞、无机汞农药的使用。汞可从植物根部和叶片两条途径进入植物体内：一是土壤中汞化物转化为甲基汞（由有机汞转化）或金属汞，被植物根系吸收；二是由叶片直接吸收进入植物体内。进入植物体内的汞，多以甲基汞与蛋白质中的硫基结合的形式运转到植物体的各个部位。汞在浓度较大时会使植物的叶、花、茎变为棕色或黑色。汞对人体的毒性极大，金属汞的毒性小于无机汞和有机汞，职业性中毒和生活性中毒大多是由金属汞和无机汞引起的。有机汞在人体内具有积累性，很难排出，生物半衰期为70天左右，因此中毒后的发病时间长，病情缓慢。汞主要侵犯人的神经系统，造成手足麻痹，全身瘫痪，神经失常，严重时可痉挛死亡。我国规定，农田灌溉水中汞的含量不得超过0.001毫克/升。
（4）铅 铅的污染源主要来自用汽油作燃料的机动车的尾气，因此，公路特别是高速公路两旁的空气、土壤、水、植物中的含铅量均高于其他地区（高100倍左右）。另外，有色金属冶炼，煤的燃烧，以及油漆、涂料、蓄电池的生产企业，都是铅污染的主要来源。铅主要被植物的根部吸收和积累，并抑制植物的光合作用和蒸腾作用，影响其正常生长。铅污染食物进入人体后有10%左右被吸收，在骨骼、脑、肝、肾等脏器内积累，会引起神经系统、造血系统和血管方面的病变。
（5）铬 铬及其化合物的污染源主要是冶金、机械、金属加工、汽车、制革、化工、医药等制造业排放的“三废”，例如金属加工厂的废水中每升含铬量可达10～5000毫克，制革厂除排放含铬废水外，还排放有毒的铬酸气。铬化合物有二价、三价和六价3种形态，二价铬和铬本身的毒性很小，六价铬对生物和人体的毒性最强，主要存在水体中，三价铬的毒性次之，主要富集在生物体内。铬虽是动植物和人体需要的微量元素，但过量的铬亦会使植物受害，抑制生长发育，并可与植物体内细胞原生质的蛋白质结合，使细胞死亡。土壤被铬污染后会抑制微生物活动，降低土壤微生物的硝化作用。植物在污染的土壤中生长，体内铬的含量可比正常情况下高出100多倍。铬对人体是一种强致癌物质。我国规定农田灌溉水中六价铬含量不得超过0.1毫克/升，世界卫生组织和联合国粮农组织规定，每人每周的耐受量，铬的摄取量定为0.0067～0.083毫克/千克（体重）。