新疆肉苁蓉，即和田肉苁蓉；内蒙古肉苁蓉，即阿拉善肉苁蓉，二者的主要区别如下：
一、产品品质特点不同
1、和田肉苁蓉：和田肉苁蓉寄生在红柳根部，晾干后非常坚硬，被药商誉为硬大芸。
2、阿拉善肉苁蓉：阿拉善苁蓉断面棕褐色，有淡棕色点状维管束，排列成波状环纹。
二、成分不同
1、和田肉苁蓉：和田肉苁蓉鲜材的有效成分为松果菊苷和毛蕊花糖苷（麦角甾苷），一般含量在100g当中含1.5g-4g不等，年份越高其含量越多，会随着水分的流失而减少。
2、阿拉善肉苁蓉：营养丰富，富含缬氨酸、赖氨酸、蛋氨酸、精氨酸等17中氨基酸；每百克干样中，总氨基酸含量4.8%以上，粗糖2%以上。
三、产地环境不同
1、和田肉苁蓉：和田地区南越昆仑山抵藏北高原，北临塔里木盆地，北低南高，并由西向东缓倾。
2、阿拉善肉苁蓉：阿拉善盟地形呈南高北低状平均海拔900-1400米，地貌类型有沙漠戈壁、山地、低山丘陵、湖盆、起伏滩地等，土壤受地貌及生物气候条件影响。
参考资料来源：
内蒙古肉苁蓉与新疆的管花苁蓉、宁夏的盐生苁蓉相比，具有肉质肥厚、茫油性大、疗效强等优点，对于研究亚洲中部荒漠植物也具有一定的科学价值及较高的经济价值。
主要分布于中国西北地区的内蒙古巴彦淖尔市、阿拉善盟、青海、新疆的柴达木盆地、诺敏戈壁、哈顺戈壁、塔里木盆地东部和雌噶尔盆地等。在蒙古人民共和国也有分布。
肉苁蓉直径可达10厘米，长度一般为40厘米-160厘米，巨型可达91公分，重量5公斤左右。全部埋藏于沙地之中。
肉苁蓉不能独立生长，只能寄生于一种叫做梭梭的植物根系生长，依靠收取梭梭体内的养料为生。它的种子在沙漠中随风飘扬，在地下一旦碰到能寄生的环境，就会紧紧粘住。
乌兰布和 - 蒙古语意为（红色公牛）。地处内蒙古西部的巴彦淖尔市和阿拉善盟境内。属中温带干旱气候，昼夜温差大。特有的日照、温差以及远离污染的特点也为营造沙漠绿色植物园奠定了良好的基础。
苁蓉的药用价值非常高，是中国的名贵药材，与大补元气、安神生津的人间良药人参并列为上品，故有“沙漠人参”之美称。
苁蓉内含有丰富的生物碱，结晶性的中性物质：氨基酸、微量元素、维生素等成分，它所含有的苯炳醉糖甙更是其它药物所没有的，它是延缓衰老最有效的成份，对人体下脑垂体、性腺、胸腺、超微结构等方面的老化具有明显的延缓作用。在我国有上千年有药用历史，是驰名中外的补肾、强身佳品。
苁蓉可用来泡茶、煮汤、炖肉、泡酒、饮料等多种方法食用，补肾阳、固肾阴、填精益髓、温肾暖宫、理气通脉、调理脏腑阴阳、提高免疫力。其药理作用为滋补肾阳，滋润胃肠，又因其性温而具有滋阴作用。
《本草纲目》介绍“肉苁蓉，养命门、滋肾气、补精血之要也。男子单丹元虚冷而阳道久沉，妇人冲任失调而阴气不治，此乃平补之 剂，温而不热，补而不峻，暖而不燥，滑而不泄，故有“苁蓉”之号。
肉苁蓉在分类学上隶属于双子叶植物纲、列当科，是国家二级保护植物，内蒙古巴彦淖尔市磴口县在乌兰布和沙区开发建立起梭梭林自然保护区及肉苁蓉繁育、种植、试验、示范、出口基地，目前，梭梭造林突破30万亩，肉苁蓉接种达到3万亩，其数量和质量均居全球之首。已成为全世界最大的肉苁蓉种苗繁育、成品销售基地。
中国第二届沙产业博览会于2009年8月8日-10日在内蒙古呼和浩特举行，磴口县必将成中国乃至世界肉苁蓉产量最大的“苁蓉县”。
依据上述资料，不管从产量、销量、质量和疗效来说，内蒙的苁蓉是最好的。
希望对你有所帮助，祝好！
品种不同，营养价值也不同，内蒙古肉苁蓉的营养价值会高很多。
内蒙古肉苁蓉属于荒漠肉苁蓉，寄主是梭梭。历史上被中医引用2000多年，《本草纲目》等均有记载，营养价值更好，价格也偏贵一些。
新疆肉苁蓉属于管花肉苁蓉，寄主是红柳。由于荒漠肉苁蓉产量的减少，管花苁蓉作为荒漠肉苁蓉的替代品，在2005年才被引入药典，营养价值没有荒漠肉苁蓉高，价格也很便宜。
分辨方法：内蒙古荒漠肉苁蓉，横截面呈花状放射性分布。
新疆管花肉苁蓉，横截面呈点状分布。
谢谢 请问4个品种是那4个 再说的详细点可以吗？我很需要详细的 小弟在此谢谢了
追答管花肉苁蓉以前不被认为是肉苁蓉，04年被加入中国药典的，现在来讲也属肉苁蓉了。中国比较多的就是以下几种：
肉苁蓉Cistanche deserticoIa Ma．
盐生肉苁蓉Cistanche salsa (C．A．Mey)G．Beck、
管花肉苁蓉Cistanche tubulosa (Schenk)R．Wight、
沙苁蓉Cistanche sinensis G．Beck、
兰州肉苁蓉Cistanche lanzhouensis Z．Y．Zhang、
迷肉苁蓉Cistanche ambigua(Bge．)G．Beck
白花盐苁蓉Cistanche salsa var．albiflor P．F．Tu et Z．C．Lou （变种）