法律分析：1、两者的角色定位不同：建设单位就是业主，出钱并监督施工的，相当于地主；施工单位是承揽项目，负责施工的，相当于长工。
2、两者的定义不同：建设单位是指建筑工程的投资方，对该工程拥有产权。建设单位也称为业主单位或项目业主，指建设工程项目的投资主体或投资者，它也是建设项目管理的主体。施工单位是由相关专业人员组成的、有相应资质、进行生产活动的企事业单位。比如，建设单位自营工程的施工队、房修队、国营建筑公司、安装公司、工程队、市政公司及集体施工企业等组织机构，都可以叫做施工单位。
3、 两者的职责不同：建设单位主要履行提出建设规划、提供建设用地和建设资金的责任。施工单位对建设工程的施工质量负责。
法律依据：《中华人民共和国建筑法》 第十五条 建筑工程的发包单位与承包单位应当依法订立书面合同，明确双方的权利和义务。发包单位和承包单位应当全面履行合同约定的义务。不按照合同约定履行义务的，依法承担违约责任。