一、名字不一样
二、地址不一样
北京站：北京市东城区毛家湾胡同甲13号
北京西站：北京市丰台区莲花池东路
三、建成年代不一样。
北京站始建于光绪二十七年（1901），原址位于前门。新中国成立后，原车站不够用，决定修建新的车站。1959年1月20日，新北京站正式破土兴建，拆除了南城根、西复兴里、复兴里、梅竹胡同、二眼井等胡同，并将毛家湾等七条胡同部分拆除，仅用了七个月零二十天，于9月10日完工，15日正式运营。北京站为建国十周年十大建筑之一。
北京西客站是国家及北京市“八五”计划的一项重要城市基础设施。为缓解北京火车站运行的紧张状态，铁道部及北京市决定在北京市丰台区莲花池新建一座大型火车客运交通枢纽站，定名为北京西站。包括客运站房、铁路引入线、市政道路及立交桥、地铁、铁路自动化通讯系统以及与其相配套的建筑群如邮政枢纽、公安等工程，投资总额达23.5亿元，于1996年竣工。
四、承担任务不一样
北京站是全国铁路客运的重要枢纽。在1996年北京西站建成以前，北京站一直是北京最重要的火车站，规模最大、设备最先进。从北京站始发的列车开往全国各地，是全中国客流量最大的车站。即使在北京西站建成以后，北京站也依旧繁忙。北京站主要担当京包线、京秦线、京哈线、京沪线、京承线等铁路的旅客运输任务，并有北京站发出开往朝鲜平壤、蒙古乌兰巴托、俄罗斯莫斯科的国际旅客列车。
北京西站是一座现代化客运站。它大大缓解了北京火车站的客运压力。该站也是京九铁路的龙头工程，这里开出的旅客列车可直达香港九龙。北京西站最高客运能力可达每日90对列车、60万人次。现今从北京到中国中南、华南、西南与西北等地区的客运列车都从北京西站发出。北京西站出发的列车覆盖华南、西南、西北地区，主要城市：香港、广州、深圳、武汉、西安、兰州、郑州、南昌、成都、贵阳、遵义、重庆、长沙、石家庄、太原、大同、福州、厦门、桂林、南宁、呼和浩特、西宁、济南、乌鲁木齐、昆明、杭州、上海等。（除东三省省会、台北外北京西站开出列车可到达中国所有其他省会城市）。
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