食品经营企业应当制定的制度如下：
1、制定本单位食品卫生管理制度和岗位卫生责任制管理措施；
2、制定本单位食品经营场所卫生设施改善的规划；
3、组织本单位食品从业人员进行食品安全有关法规和知识的培训，培训合格者才允许从事食品流通经营；
4、建立并执行从业人员健康管理制度；
5、执行食品安全标准；专供婴幼儿和其他特定人群的主辅食品，其标签还应当标明主要营养成分及其含量；
6、协助食品安全监督管理机构实施食品安全监督、监测；
7、实行统一配送经营方式的食品经营企业，可以由企业总部统一查验供货者的许可证和食品合格证明文件，进行食品进货查验记录。
为什么要建立食品进货查验记录制度?
查验记录制度是食品生产企业建立追溯体系的具体手段。一方面有利于食品可追溯，确保监管链条不断，另一方面也可以保护生产经营企业自身的权益。
《食品安全法》第42条规定，食品生产经营者应当建立食品追溯体系，保证食品可追溯。如何做到食品可追溯，做好相应的信息记录，是必不可少的措施。
法律依据：
《中华人民共和国食品安全法》第三十三条
食品生产经营应当符合食品安全标准，并符合下列要求：
（一）具有与生产经营的食品品种、数量相适应的食品原料处理和食品加工、包装、贮存等场所，保持该场所环境整洁，并与有毒、有害场所以及其他污染源保持规定的距离；
（二）具有与生产经营的食品品种、数量相适应的生产经营设备或者设施，有相应的消毒、更衣、盥洗、采光、照明、通风、防腐、防尘、防蝇、防鼠、防虫、洗涤以及处理废水、存放垃圾和废弃物的设备或者设施；
（三）有专职或者兼职的食品安全专业技术人员、食品安全管理人员和保证食品安全的规章制度；
（四）具有合理的设备布局和工艺流程，防止待加工食品与直接入口食品、原料与成品交叉污染，避免食品接触有毒物、不洁物；
（五）餐具、饮具和盛放直接入口食品的容器，使用前应当洗净、消毒，炊具、用具用后应当洗净，保持清洁；
（六）贮存、运输和装卸食品的容器、工具和设备应当安全、无害，保持清洁，防止食品污染，并符合保证食品安全所需的温度、湿度等特殊要求，不得将食品与有毒、有害物品一同贮存、运输；
（七）直接入口的食品应当使用无毒、清洁的包装材料、餐具、饮具和容器；
（八）食品生产经营人员应当保持个人卫生，生产经营食品时，应当将手洗净，穿戴清洁的工作衣、帽等；销售无包装的直接入口食品时，应当使用无毒、清洁的容器、售货工具和设备；
（九）用水应当符合国家规定的生活饮用水卫生标准；
（十）使用的洗涤剂、消毒剂应当对人体安全、无害；
（十一）法律、法规规定的其他要求。
非食品生产经营者从事食品贮存、运输和装卸的，应当符合前款第六项的规定。
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