二郎腿的坏处有，可能导致下肢的深静脉回流产生异常，从而引发静脉回流异常，会导致血栓形成的几率增加。
如果本身已经有下肢深静脉血栓，还容易导致栓子脱落，而栓子脱落之后会随着血液循环进入下腔静脉，最终到达肺部形成肺栓塞，而严重的肺栓塞甚至可以导致死亡，所以跷二郎腿最大的危害就是下肢深静脉血栓形成。而其它较为少见的有可以导致神经的压迫损伤，如果是做关节置换手术的患者，还有可能导致髋关节脱位。
现代人爱翘二郎腿。但翘二郎腿坐着的时候容易弯腰驼背，造成腰椎与胸椎压力分布不均，长此以往，势必压迫脊椎神经，引起下背痛。而据美国纽约市静脉治疗中心负责人说，翘二郎腿还会妨碍腿部血液循环，造成腿部静脉曲张，严重者常出现腿部静脉回流不畅、青筋暴突、溃疡、静脉炎、出血和其它疾病。
架腿而坐，跷一脚，谓之二郎腿。诗人流沙河曾撰有《二郎腿的解释》一文，饶有风趣地解释了二郎腿的来历。他指出：不但川省有此说法，外省也有。这是二郎神的坐姿。鄙人故乡川王庙正殿上所塑二郎神像，以及吾蜀都江堰二王庙旧时二郎神像，皆如此状。二郎其人，传说是秦时郡守李冰的次子，助其父凿离堆，斩蛟除害，死后封二郎神。《封神演义》有二郎神杨戬，由传说而小说，更荒诞不经了。
很多人坐在椅子上，会习惯性地跷二郎腿，觉得这样比较舒服。一些人还把跷二郎腿当作一种优雅的姿势。但专家提醒，跷二郎腿可能引发不少病。可能引发腿部静脉曲张或血栓塞。北京医院心内科副主任刘德平在接受《生命时报》记者采访时说，跷二郎腿时，被垫压的膝盖受到压迫，容易影响下肢血液循环。两腿长时间保持一个姿势不动，容易麻木，如果血液循环再受阻，很可能造成腿部静脉曲张或血栓塞。“特别是患高血压、糖尿病、心脏病的老人，长时间跷二郎腿会使病情加重。