紧急求助 关于退税冲红问题
我公司与2008年8月申报了一个合同的进料加工免税证明，申请的免税金额为31868.66，后来税务局的人说的这样报不对，应该按退税方式申报，于是又在同年9月申报了该合同退税，后来该退税款已入账，另外在2009年3月申报的退税款共计51552.44元，但在09年10月收到退税款后发现扣掉了31868.66元，经查是由于08年8月申报的进料加工免税证明抵扣了部分退税款。
后来，我们找了办税人员，他让我们写份情况说明交给他们科长，然后再科长那压了好久，于是我们自己就直接找到了科长，不过被科长拒绝了，说改不了了认倒霉吧，可是我明明听办税人员说可能科长给和局长打个招呼的，现在是否我们自己在申报一份红字（负数）的免税证明，就能够把这些钱退给我们呢？
有没有TX遇见过类似的情况呢？