《孤岛危机3》故事发生在上作《孤岛危机2》之后，纽约已经包裹在Nanodome当中的城市，成为热带雨林，长满树木，茂密的沼泽地和湍急的河流；
其中分成为七个不同的和变化莫测的环境，《孤岛危机2》当中的先知，研发出一个致命的复合弓箭，增强的纳米服和毁灭性的外来高科技，成为这个星球上最致命的猎人。
纽约树立起了巨大的保护屏障来保护城市，政府宣传的目的是为了保护人类不受外星人的影响和袭击，实际上这个保护屏障的背后是CELL企图用武器和科技征服世界的野心。
因此二代中继承了先知名字和意志的主人公——本名阿兹卡特的陆战队成员跟随前暴龙小队成员
扩展资料：
孤岛危机3特色系统：
多人模式：
多人模式分为两个模式：猎人模式和撞击点模式（Crash-Sitemode）。游戏在主机和PC上的人数上限分别是12和16。主机版和PC版都允许玩家们自定义他们的装备。主要武器有17种，每种都有自己的配件，人物一共最高50级，50级之后可以转生，美名其曰“重启生化服”
猎杀者模式：
猎杀者多人模式下玩家可以选择身穿纳米服的并且可以隐身的超级战士，亦或是没有纳米服的普通战士，但是前者只能选择肉搏性的武器，比如弓箭等等，而后者则有更多枪械可供选择。