1、 血清转氨酶
丙氨酸转氨酶和天门冬氨酸转氨酶主要存在于肝细胞内，它们在肝细胞内的浓度比血液中的浓度高出1000~5000倍。如果肝细胞因炎症而出现损伤时，细胞内的这些酶就会释放到血液中来，引起血清转氨酶升高。所以，血清转氨酶是反映肝细胞损害的最灵敏指标。但当出现肝细胞大面积坏死（如暴发性肝炎），肝内转氨酶已耗竭殆尽时，血清转氨酶升高可以不明显。
2、 胆红素
正常情况下，胆红素需要通过肝脏加工处理，然后经胆道排出体外。经肝脏处理后的胆红素称为直接胆红素，未经处理的称为间接胆红素。直接胆红素和间接胆红素的总和为总胆红素。肝细胞病变时可出现总胆红素升高，且以间接胆红素升高为主，表明解毒能力下降。但肝脏对胆红素的代谢具有较强的代偿能力，所以在疾病早期总胆红素和间接胆红素可以不升高。
3、白蛋白、球蛋白
白蛋白由肝脏合成，其浓度下降可能提示肝细胞合成功能受损。但白蛋白的半衰期较长，约15~20天，所以急性期病人白蛋白浓度可以正常。肝硬化患者常见白蛋白水平下降，球蛋白水平上升。白蛋白与球蛋白两者正常比例在1.5~2.5，若两者的比例1时，医学上称之为“白/球比”倒置，是肝硬化的临床特征之一。
4、总胆固醇和胆碱酯酶
肝细胞参与胆固醇和胆碱酯酶的合成代谢，这两项指标反映了肝脏的储备功能、疾病的恢复能力，肝病患者如果胆固醇和胆碱酯酶持续严重下降则表明疾病在进行性恶化，处境危险。
5、碱性磷酸酶和谷氨酰转肽酶
血清碱性磷酸酶和谷氨酰转肽酶是反映胆汁淤积的重要指标。在肝内、外胆道梗阻的情况下（例如肿瘤、结石），由于胆汁排泄不畅，它们会同时明显升高，且多伴有直接胆红素上升。儿童和青少年因骨骼发育会出现单项碱性磷酸酶升高，属正常生理现象，不要误认为肝功异常。
6、甲胎蛋白
严格地说，甲胎蛋白不属于肝功检查项目，但有时医生会提出检查要求，其有双重意义。一是，轻度升高多提示肝炎活动、肝细胞再生活跃，这对重型肝炎特别有意义，表明病人有望恢复；二是，长期显著升高常提示肝癌，一般认为，当甲胎蛋白超过500 ng/L、持续4周以上，或200~500ng/L、持续5周以上时应高度警惕肝癌的可能。应该注意的是，孕妇也可出现甲胎蛋白升高，此为胚胎发育所致，不要和肝病混为一谈。