内蒙古自治区妇幼保健院在自治区临床医学领域中，以其出色的产科和新生儿科成为了领先学科。2009年，医院的产科门诊量达到4.2万人次，其中产科分娩量为4712人，占呼和浩特市区出生人口的三分之一。剖宫产率为37.5%，这个比率在全国同等级别的医院中表现出较好的成绩。
新生儿科是医院的一大亮点，他们拥有国内一流的新生儿重症监护室（NICU）。医院实施了一种独特的服务模式，即新生儿科医师一对一陪护分娩，这种国际先进的陪产方式已经坚持了20年，为新生儿的平安出生提供了强大的保障。这一举措在保障新生儿健康方面发挥了重要作用。
为了满足更多家庭的需求，医院扩大了服务范围，设立了好妈妈准爸爸育儿学校，创新了妇幼科普教育的方式，帮助家长更好地照顾新生儿。此外，医院还成立了新生儿、儿童听力筛查诊断中心，乳腺疾病和宫颈疾病筛查诊治门诊，以及产前诊断和新生儿疾病筛查实验室，这些举措填补了自治区在相关领域的重要空白，提升了医疗服务的专业性和全面性。
内蒙古自治区妇幼保健院 内蒙古自治区妇女儿童医院坐落在自治区首府呼和浩特市，于1987年自治区成立40周年之际正式开诊，经过近20年的建设发展，现已成为自治区唯一一家集保健、医疗、教育、科研为一体的三级甲等妇幼保健专科医疗机构，是世界卫生组织、联合国儿童基金会、联合国人口基金会项目合作单位以及内蒙古医学院和包头医学院的临床教学基地。